西瓜是世界上最重要的农作物之一,嫁接法是西瓜生产中试图提高其在生物和非生物胁迫适应中的常用方法,特别是对土传枯萎病。MicroRNAs(miRNAs)是一类内源性非编码小RNA, 参与转录后基因调控,在植物生长,发育和胁迫应答中起着关╳键的作用。然而,我们对miRNA参与嫁接行为知之甚少。
近期,北京市农林科学院国家蔬菜工程技术研究中心许勇教授和浙江大学园艺系农业部园艺植物生长发育与生物技术重点开放实验室张明方教授领衔的团♀队,利用第二代测序技术(Solexa测序)深入挖掘西瓜嫁♂接系统中全基因组范围的小RNA群体,并对miRNA组进行了系统研究*,该研究成果发表在近期的PLoS ONE上。生物通研究者先从两片真叶期的自我嫁接西瓜,西瓜嫁接至葫芦和西瓜嫁接至南瓜的接穗♀中采集3个样本,测序分别获取了总量为11458476,11614094和9339089的原始Reads,代表了2957751,2880328和2964990条唯一的序列♂(小RNA测序由联川生物承担完成)。在作者构建的小RNA数据库≡中鉴定出39个已知miRNA隶属于30个miRNA家族和80个新的miRNA。与自我嫁接西瓜相比, 20个(5个已知miRNA家族的miRNA和15个新的miRNA)和47个(17个已知miRNA家族的miRNA和30个新的miRNA)表达在西瓜嫁接到葫芦→和南瓜中显著不同。当西瓜嫁接到不同根茎时,miRNAs表达具有差异,表明miRNA可能在西瓜不同的生物代▂谢过程中发挥重要的作用,而嫁接可能通过改变miRNA的表达来调节植物的生长发育以及》对逆境的适应。
本研究】获得的小RNA转录组为嫁接西瓜中miRNA介导调控的分子机制提供了视野。同时,这一结果将为进一步解开嫁接西瓜接穗和根茎中miRNA信息交换的机制,以及其与不同生物过程和环境适应的相关性提供基础。