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                今日只招-质粒DNA的小量制备

                教育装备采购网 2014-05-06 14:07 围观1205次

                  实验试剂1. 溶液I

                  50mmol/L葡萄糖

                  25mmol/L Tris.Cl(pH8.0)

                  10mmol/LEDTA(pH8.0)

                  溶液I可成批配制,每瓶约100ml,在6.895×104Pa高压下蒸气灭菌15分钟,贮存于4℃。

                  2. 溶液Ⅱ

                  0.2mol/L NaOH(临用前用10mol/L贮存液现用现稀释)

                  1%SDS

                  3. 溶液Ⅲ

                  5mol/L乙酸钾 60ml

                  冰乙酸 11.5ml

                  水 28.5ml

                  所配成的溶液对钾是3mol/L,对乙酸根∏是5mol/L。

                  4. STET

                  0.1mol/L NaCL

                  10mmol/L Tris.Cl(pH8.0)

                  1mmol/L EDTA(pH8.0)

                  5% Triton X-100

                  5. 溶菌酶溶液

                  10mg/ml,用10mmol/L Tris.Cl(pH8.0)配制。

                  实验步骤1. 细菌的收获

                  1) 将2ml含相应抗生素Ψ的LB加入到容量为15ml 并通气良好(不盖紧)的试管中,然后接入一单菌落,于30℃剧烈振摇下培养㊣ 过夜。

                  2) 将1.5ml培养物倒入微量离心管中,用微量离心※机于4℃以12000g离心30秒,将剩余的培养物贮存于4℃。

                  3) 吸去培养液,使细菌沉淀尽可能干燥。除去上清的简●便方法是用一次性使用的吸头与真空管道相连,轻缓抽吸,并用吸头接触液面。当液体︽从管中吸出时,尽可能使吸头远离细菌沉淀,然后继♀续用吸头通过抽真空除去附于管壁的液滴。

                  2. 碱裂解法

                  1) 将细菌沉淀,所得重悬于100μl用冰预冷的溶液I中,剧烈振荡。须确使细〓菌沉淀在溶液I中完全分散,将两◣个微量离心管的管底部互相接触震荡,可使沉淀迅速分散。

                  2) 加200μl新配制的溶液Ⅱ。盖紧管口,快速颠倒离心管5次,以☉混合内容物。应确保离心管的整个内表面均与溶液Ⅱ接触。不要振荡,将离心管放置于冰上↑。

                  3) 加150μl用冰预冷的溶液Ⅲ,盖紧管口,将管倒置后和地振荡10秒钟溶液Ⅲ在粘稠的细菌裂解物中分散均匀,之ω后将管置于冰上3-5分钟。

                  4) 用微量离』心机于4℃12 000g离心5分种,将上清转移到另一离心管中。

                  5) 可做可不做:加等量酚:氯仿,振荡混匀,用微量离心机于4 ℃以12000g离心2分钟,将上清转移到另一良心管中。有些工作者认为不∞必用酚:氯仿进行抽提,然而由于一些未知的原因,省略这一步,往往会得到可耐受限制酶切反应的DNA。

                  6) 用2倍休积的乙醇于室温沉淀双链DNA。振荡混合,于室温卐放置2分钟。

                  7) 用微量离心机于4℃以12 000g离心5分钟。

                  8) 小心吸去上清液,将离心管倒置于○一张纸巾上,以使所有液体流出。再将附于》管壁的液滴除尽。除去上清的简便方法是用一次性使用的吸头与真空管道相连,并用吸头接触液面。当液体从〓管中吸出时,尽量使吸↑头远离核酸沉淀,然后继续用吸头通过抽真空除去附于管壁的液滴。

                  9) 用1ml70%乙醇于4℃洗涤双链DNA沉淀,按步骤H所术方法去掉上清,在空气★中使核酸沉淀干燥10分钟。

                  注:

                  1. 此法制备的高拷贝数质粒(如Xf3或pUC),其产量一般约为:每毫升原细菌培养物3-5μg。

                  2.如果要通过限制酶切割反应来分析DNA,可取1μl DNA溶液加」到另一含8μl水的微量离心管内,加1μl 10×限制酶缓冲液ζ和1单位所需限制酶,在适宜温育1-2小时。将剩余的DNA贮存于-20℃。

                  3. 此方法按适当比例放大可适用于100ml细菌培养物:

                  3. 煮沸裂解

                  1) 将细菌沉淀,所得重悬于350μlSTET中。

                  2) 加25μl新配制的溶菌酶溶液,振荡3秒钟以混匀之。如果溶ζ 淮中pH低于8.0,溶菌酶就不能有效发挥作用。

                  3) 将离心管放入煮↓沸的水浴中,时间恰为40秒。

                  4) 用微量离心机于室温以12 000g离心10分种。

                  5) 用无菌牙签从微量离心管中去除细菌碎片。

                  6) 在上清中加入40μl 5mol/L乙酸钠(pH5.2)和420μl异丙醇,振荡混匀,于室温放置5分钟。

                  7) 用微量离心机于4℃以12 000g离心5分种,回收核酸沉淀。

                  8) 小心吸去上清液,将离心管倒置于一※张纸巾上,以使所有液体流出。再将附于管壁①的液滴除尽。除去上清的简便方法是用一次性使用的吸头与真空管道相连,轻缓抽吸,并用吸头接触液面。当液体从管中吸出时,尽可能使吸头远离核酸沉淀,然后继续用吸头通过抽真空除去附于管的液滴。

                  9) 加1ml 70%乙醇,于4℃以12 000g离心2分钟。

                  10) 按步骤H所述再次轻轻地吸去上清,这一步操作要格外小心,因为有时沉淀块贴壁不紧,去除管壁上形成的所有乙醇液滴,打开管口,放于室温直至乙醇挥发殆尽,管内无可见的液体(2-5)分钟。

                  11) 用50μl含无DNA酶的胰RNA酶(20μg/ml)的TE(pH8.0)溶解核酸稍加振荡,贮存于-20℃。

                  注:当从表达内切核酸酶A的大∴肠杆菌株(endA 株,如HB101 )中小量制粒尤其DNA时,建议舍弃煮沸法。因为煮沸步骤不能完全灭活内切核酸酶A,以后在Mg2 存在下温育(V中用限制酶时)质粒DNA可被降解。在上述方案的【步骤I之间增加一步,即用酚:氯仿进行抽提,可以避免这一问√题。

                 

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