在发酵工业中广为应用的酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)，也是一种在生命科学研究中常用的模式生物。由于其较清晰的遗传背景、相对↙较小的基因组、完善的基因组和功能基因组学研究积累、明确的有性生殖循环等优势，除分子生物学领域外，正在成为比较与进化基因组学、生物地理学、群体遗传学、生态学和物种形成与演化机制等研究领域的模式生物。然而，我们对这种也许是被研究得最为透彻的真核微生〓物在自然界中的生态分布和群体结构仍然所知甚少。以前的研究主要基于实验室和人工环境菌株，真正的野生菌株很少涉及。因此，我们对S. cerevisiae的遗传多样性、驯☉化群体的起源与演化及人工选择对☉其表型和基因组变异的影响等基本问题很难进行充分的阐释。
近几年来，中科院微生物研究所真菌学国家重点实验室的白逢彦研究组对S. cerevisiae在自然界的生态分布进行了大规模调查，从分布在不同◥气候带、人工干扰程度不同的环境，包括人迹罕至的原始森林中，采集了数千份※样品，使用特殊的选择性分离方法，成功分离出大量酿酒酵∴母菌株。进而对99株代表性菌株进行了群体遗传学、分子核型和有性生殖隔离等方面的研究。结果表明，S. cerevisiae在自然界中广泛分布，且存在明显的种群分化;与预想结果相反，树皮、森林土壤和腐木▓等样品的S. cerevisiae分离率均比各种果实样品的更高。野生S. cerevisiae存在清晰的群体结构，从测序的野生菌株中识别出了8个独立》的演化谱系(CHN I-VIII)。来自原始森林的谱系(CHN I-V)位于演「化树的底部，且已发生Ψ 显著的遗传分化;而来自次生林、果园和※果实的谱系(CHN VI-VIII)与工业应用(驯化)谱系一起，位于演化树的上部，且群体分化程度较低。这一结果显示了S. cerevisiae从原始森林▅，到次生林，人工环境，再到工业☆发酵过程的演化路径。原始森林谱系一般为自交群体，具有不同的分子核型，并已产生一定程度的生殖隔离;而人工环境谱系存在更多的遗传重组事件，人为因素促进了其群体间的ζ杂交。与以前群体▽遗传和群体基因组学研究中应用ζ的，被认为已代表了S. cerevisiae全球遗传多样性的一批菌株相比，我国菌株的遗传多样性指数高出〖近1倍。这一结果显示中国，或者东亚，可能是S. cerevisiae的起源中心。此外，该研究还在S. cerevisiae群体结构的塑造因素ζ 和葡萄酒及清酒驯化谱系的起源等方面，提出了新ω 观点。
上述研究已发表于Molecular Ecology (21: 5404C5417, 2012)，期刊并在『同期为本篇论文配发了一篇评论(Perspective)。评论指出，这一研究大幅度地提高了我们对酿酒酵母菌』多样性的认识水平，并将大大提升我们对其生态、驯化和演化等方』面的研究能力。
