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Lynnon Biosoft 为激动人心╳的基因组科学的教育、研究和开发开发和销售生物信息学软件平台。我们的产品 DNAMAN 软件包为序列分析和数据挖掘提供了一个有效的工具包』。
什么是DNAMAN
DNAMAN适用于分析生物学应用的一体化软件包。改软件包为序列分析提供了一个就有多种功能的集成系统。您不○再需要一个程序进行限制性分析，而其他程序进行多序列对比、设计PCR引物、蛋白质序列分析或绘制质粒.....DNAMAN为您执行这些任务。
DNAMAN的速度、多功能性、准确性和高质量的演¤示使其成为每个分子生物学家可以依赖的基本】工具之一。DNAMAN是众多评审科学期刊中高度引用的序列〗分析软件。他也是一个序列々分析软件包，每所大学、研究机构、实验室和研究科学家都可以负担的起。
DANMAN可用于Microsoft Windows、OSX和Linux。三个平台上的DANMAN文件共享相同的格式。
DANMAN的通用◥格式系统方便了Windows、Mac OSX和Linux之间♀的通信，使您的平台独立。
DNAMAN 序列分析功能简介
序列分析集成系统
Windows、OSX 和 Linux 上的 DNAMAN 桌面
适用于 Windows 的 DNAMAN
用于 OSX 的 DNAMAN
用于 Linux 的 DNAMAN
序列操作
序列□处理和转换
序列输入
DNAMAN 序列是用关键字格式化的纯文本文件。该程序接受其他常见的序列格式，例如 GenBank、GCG、CUSTAL、FASTA、PIR 和 GDE。DNAMAN 利用序列通道将活动序列保ㄨ存在内存中以进行快速计∮算。数据库也可用于帮助组织特定研究项目的◥序列。三个序列输入界面均可在 DNAMAN Desktop 上访问。
序列组成和转№换
DNAMAN 使用简单的下拉菜单命令报告序列组成和分子量。它可以将序列↓转换为其反向、互补、反向互补、双链和 RNA 序列。
序列搜索
列搜索
DNAMAN 提供用于序列搜索和比较的工具，包括核苷酸或▲氨基酸序列、共有序列、开放阅读框、重复序列。小干扰 RNA (siRNA) 选择工具可用于提高 siRNA 设计』的质量。用户可以在 DNAMAN 程序中对 NCBI 数据库或其他基于网络的序列服务器执行 BLAST 搜索。
限制分析
DNAMAN 为 DNA 序列⌒ 的限制性分析提供直观的界面。结果可以显示为文本、限制图和限制模式（琼脂糖凝胶）。其他工具包◢括电子克隆、从片段重建限制性▽图谱、静默突变和定向错配。
序列组装
DNAMAN 使用快速准确的比对算法来组装大量序列。跟踪文件可以直接用于汇编。SNP可以通过组装的序列集≡进行验证。
同源比较
点阵图
可以使用点图在 DNAMAN 中分析大序列的同源区域。感兴趣的序列区域可以放大并直接对齐。
两个序◥列比对
DNAMAN 提供了快速或ζ 优化的算法来比对两个 DNA 或蛋白质▓序列∩。
多序列比对
DNAMAN 使用 ClustalW 算法（Feng-Doolittle 和 Thompson）进行对齐，使▂用全局对齐算法（Wilbur 和 Lipman）进行快速对齐。DNAMAN 中的三种比对提供了高质量的比对结果。使用快速比↘对方法，您可以快速比对大量 DNA 或蛋白质序列。可以在多比对序列编辑器中进一步修改或调整比对。
系统发育「分析
DNAMAN 使用通用算法计算同源矩阵并建立全部序列对之间的相关距离。它可以生成距离矩阵，并从多个比对中绘制系统发育树或同源树。自举分析可用于系统发育树的置信度值。
引物/寡核苷酸分析
PCR引物设计
DNAMAN 为 PCR 引物选择提供了控制标准。您可以︻通过设置目标 DNA 的区域、PCR 产物的大小、引物特性、反应条件和引物配置来优化引物过滤。
其他功能
可以分析寡核苷酸引物的解链温度、互补性、错误引物、沉默突变和定向错∞配。
蛋白√质分析
蛋白质序列分析
DNAMAN 提供了用于蛋白质序列分析的工具，包括：从两个 DNA 链中翻译六个阅读●框、遗传密码表的变异、阅读框概述、密码子使用分析、氨基酸※组成、亲水谱、电荷和 pI 分析、二级结构预测和反向ξ翻译。
数据库管理
DNAMAN 数据库管理
DNAMAN 使用标准关系数据库引擎 Sqlite3 来管理 DNA/蛋白质∏序列和寡核苷酸序列。
LBDraw（限 Windows）
LBDdraw的特点
在 Internet 上（限 Windows）
适用于 Windows 的内置 DNAMAN Internet/Intranet 浏览器
DNAMAN 提供了一个集成的 Web 浏览器来访问 Internet 或您的 Intranet。
