FlexS是一个精确的3D分子叠合程序。给定一对配体分子，FlexS可以预测某个配体相对参考配体的构象及取向。在FlexS当中，参考配体是刚〗性的，最好是结合状态的构象。
重要特性
** 运∩算速度快：在一次测试中，针对280对分子，FlexS只需平均2分钟即可完成叠合；
** 考虑配体柔性：在□叠合过程中，会考虑转角及构象柔性；
** FlexS的置位算法基于分子之间共同的相互作用对。因此确保搜索限定在低能构象范围内；
** FlexS基∮于成熟的物理化学模型。用MIMUMBA转角数据库来创建构象。打分函数中▃，Bohem函数被用来评价分子叠▲合程度的好坏。
重要应用
** 3D分子叠合
** 输出结果可用于3D QSAR分析
** 发现骨架/化合物类似物
** 基于配体的虚拟筛选
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