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                应用领域

                生物信息学
                结构和家族数据库、折叠/同源辨识、序列比对、保守区域搜索

                化学信息学
                描述符、相似性和多样性、构象数据库、3D搜索、药效团搜索/建模、 2D分子、‘结构-活性’分析、RECAP分析、SD Pipeline 命令

                高通量发现
                高通量筛选、二元QSAR、3D QSAR、组合库设计

                基于结构的药物设计
                配体开发、活性位点↘查找、接触势计算、分子对接、碎片分析、蛋白-配体相互作用、指纹图谱、BREED、3D加氢、Protomer和Tautomer、分子表面图、SAReport

                蛋白建模
                同源模建、残基突变、分子力学、分子☆动力学、抗体模建、蛋白pKa

                分子模拟
                力场、静电计算、分子力学、分子◥动力学、扩散、3D小分子构建、分子表面

                方法开发与部署
                原型、整合、分布式计∞算

                MOE/web
                SD Filter、结构-活性报告、同源搜索、小分子性质、数据库浏览ω 

                重要特性

                跨平台计♂算

                MOE可以支持所有主流的硬件架※构和操作系统,包括:Windows 2000XPVista|7, Linux, MacOS X, Solaris 8-10, IRIS 6.5等。MOE 所有的视窗和操作在各种平台下表现一致,性能均非↙常优越。

                多任务】环境

                MOE是多任◆务模式的,用户可↙以在MOE里同时」运行多个任务而不会产生冲突。例如你∑可以在对一个分子体系做能量最㊣ 小化的同时对分子表面着色以观察作用力的变化。你可以同时运行任意数目的应用程序。

                命令行及Web模式

                MOE可以作为命令行程序△运行,即MOE/batch;在此模式下,除了图形界面,MOE的所有功能都可以①正常使用。MOE/web是另一种运行模式:当用户々想通过Web页面使用MOE时,只需要打开浏◣览器就可以使用另外一台联网计算机上的MOE程序。

                并行计算模式

                MOE/smp是MOE及MOE/batch的∴增强模式, 用户可以在此模式下使用多个处理◥器, 来共同完成大规模分布式计算↑。一个MOE进程可以分布到各种不同的计算资√源上,例如笔记本、工作站、多处理器超级计算机等等▓,甚至是不同的操作系统,例如UNIX和Windows。

                使用SVL编程

                MOE一个鲜明特点就是开放架构:高级编程语言SVL,即科学向量语言(Scientific Vector Language), 为用户带来了高度的灵活性。在MOE中,用户可〗以快速地使用SVL开发新方法或实现新构想。使用SVL编写的程序适用于所有运行MOE的平台。

                程序范例

                MOE的安装目】录下包括一批范例SVL程序,位于$MOE/sample目录下,用户可以从中学习如何编写SVL程序。

                CCG期刊

                CCG官方网站有一栏叫做CCG期刊,收集了关◎于MOE里应用程序和算法文章。

                MOE在高水平研究工作中应用

                MOE作为一个综合的分子模拟及药〗物设计软件,在大量研究工作中都有广泛的作用,每年利用MOE在高水平杂志上发表的论文有数百篇之多。这些杂◤志包括: Nature、Science、Proceedings of the National Sciences of U.S.A、Journal of the Amerian Chemical Society、Journal of Biological Chemistry、Joural of Medicinal Chemistry等等。CCG官方网站上对此有专门的收集和整理
                SVL程序共享

                MOE的开发人员和用户有时会编写一些有用的SVL程序,并上传到SVL程序交换(SVL Exchange)站点◣实现共享。对用户而言,这是一个非常有价值的资源。

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