BioNumerics是能够以生物学的各种试验数据作为输入数▓据∑,以强大的整合数据库为中心,对生物学数据进行比较,分析,研究的系统。它有以下三个重要特征:
1.数据管理:提供对指纹图谱、2D胶、基因序列、基因芯片、基因表型特征、矩阵、曲线和动力学描述等所有生物学数据存储,提取,搜索功能,非常适合做生物实验室数据管理的核心。
2.数据分析:通过对数据进行比较筛查,分析数据之间的不同点和相似性,从而☉将数据进行分类,定义,和统计学分析,并可用来鉴定未知的生◥物体。BioNumerics分析功能的独特之处在于它可※以综合多次试验或者不同实验方法的结果,更加全面、快速的分析生物学▓数据。
3.网络共享:使用BN提供的网络共享功▆能,在指定的网络里,用户之间可以方》便地交换共享生物数据,并能导入互联网上知名的专ㄨ业数据库。
BioNumerics很好的满足了研究机构或诊断机构对不同的生物学★数据进行分析的要求。这套软件系统已经得到了很♂多研究机构,包括大学,医院,公ζ共医疗中心,食品,药物和制药企业等各种实验室的广泛认可。
6大应用模块:
· Fingerprint types:
处理PFGE, AFLP, RFLP, RAPD, REP-PCR, ARDRA, IEF,DGGE, TGGE等电泳数据;气相色谱ζ 和HPLC数据;DHPLC数据; 分光光度曲线等数据。
· Character types:
处理生物抗性实』验数据;脂肪酸甲基○化脂(FAME)分析数据;生物显性阵列数据;API表型测︽试数据;微阵列芯片数据;生化试验数据;酶活和代「谢活性数据等。
· Sequence types:
处理核酸(DNA或RNA)和氨基※酸序列;自动测序仪(Applied Biosystems, Beckman, Amersham)得到的←色谱文件;广泛的识〇别各种序列格式, 包括EMBL, GenBank和Fasta格式。
· Trend data types:
处理实时荧光定量 PCR数据;代谢活性和酶活性的动力学数据①;微阵列实验中的时间进程数据等和№趋势相关的实验数据。
· 2D gel types:
处理双向凝胶电泳试验数据;DIGE试验数据。可以将从2-D胶中鉴定到的蛋白点被直接存储在数据库中。
· Matrix types:
处理DNA同源性◆相似度的表格数据;DNA杂交数据等矩阵』类型数据。
6大分析模块:
· Tree and Network Inference:
在BioNumerics中通过把︾关系数据库中的各种记录之间,多种试验之间,用多种有效的聚类算法可以实现多种聚类分卐析。Bionumerics 6.0 还提供了独特的专利技术评估聚々类分析的可靠性。
· Identification: 根据生物试验数据结果来鉴定◤未知的生物体或物种,可构建⊙文库。
· Molecular Analysis Tools: 开放读码框架分◥析,预测蛋白序列。限制性酶切分析,引物设←计等。
· Dimensioning techniques: 多维的数据存储,方差分析等生物学数据统计分析。
· Database Sharing Tools:数据库共享工具。
· Audit Trailing and Versioning:适用于GLP实验室