文 / Chuck Huber, Director of Statistical Outreach at StataCorp
导读
在之前的文章中,作者演示了如何利用蒙特卡罗模拟计算功率的t检验的示例,以及如何把你的模拟集成到Stata的power
命令中。本文,作者将向您展示如何为线※性和逻辑回归模型执行这些任务。线性回归和逻辑∑ 回归程序的策略和整体结构类似于t检验示例。不同点在于数据模拟和用于检验零假设的模型。
在模拟回归模型时,选择『现实的回归参数是很具有挑战性的。有时,pilot data 或historical data可以提▽供思路,但通◎常我们会考虑一系列我们认为有意义的参数值。本文将通过基于全国健康㊣ 和营养检查调查 (NHANES) 数据做为示例。可以通↘过键入webuse nhanes2
来下载这些数据的一个版本。
线性回归示例
假设您正在计划一项systolic blood pressure (SBP) 研究,并且您认为年龄和性别之间存在相互作用。NHANES 数据集包括变量bpsystol (SBP)
、age
和sex
。下面,我们拟合了一个线性回归模型,其中包ζ 括一个age
与sex
的交互项,并且所有参数估计的p
值都等于 0.000
。这并不●奇怪,因为该数据集ζ 包含 10,351
个观测值。当其他一〓切保持不变时,随着样↓本量变大,p
值变小。
也许您没有资源为您的研【究收集 10,351
名参与者的样本,但如果希望有 80%
的功◆效来检测0.35
的交互参数。您的样本需要多大?
让我们首先根据 NHANES 模型的参数估计创建单个伪随机数据集。我◥们通过清除Stata的内存开始◇下面的代码块。接下来,我们将随机种子设置为 15,以便我们可以〓重现我们的结果并将观察次○数设置为 100。
代码块的第四行生成一个名为age
的变量 ,其中包括从区间[18,65]
上的均匀分布中提取的整数。
第五行使用概率等于0.5
的 Bernoulli distribution 生成一个名为female
的︽指示变量。回想一下,一次试验的◤二项式分布等价于 Bernoulli distribution 。
第☉六行生成了 age
和 female
交【互作用的变量。
第七行生成一个变量e
,即回归模型的误↑差项。生成了误■差由均值为 0
且标准差为 20
的正态分布。值 20
基于从NHANES
回归模√型估计的root MSE
。
代码块的末行基于我们的模拟变量和来自NHANES
回归模型的参数估计的线性组合生成变量sbp
。
以下是使用regress
拟合我们的模拟数据的线性模型的结果。参数估计与我们的输入参数有些不同,因为我只生成了一个相对较小的数据集。我们可以通过增加∩样本大小、抽※取大量样本或两者兼而有之的方式来减ㄨ少这种差异。
交互作用项的p
值等于 0.420
,这在 0.05
水平上不具有统计∞显着性。显然,我们需要更大的样本量。
我们可以使用回归模型中的p
值来检验交互项为零的原假设。这在本例中是可行的,因为我们只测试一个参数。但是,如果我们的交互包含一▅个分类变量,例如race,我们将不得不同时测试多个参←数。有时我们希望同时测试多个变量。
Likelihood-ratio tests可以检验多▓种假设,包括同时检验多▆个参数。我将在本示例☆中向您展示如何使用Likelihood-ratio tests,因为它将涉及到您在研▓究中可能遇到〇的其他假设。如果您不熟悉它们,您可以在Stata Base Reference Manual
中阅读有关■likelihood-ratio tests的更多信息。
下面的代码块显示了用于计算likelihood-ratio tests的五个步骤中的四个。我们将检验交互项的系数为零的原假设。首行拟》合包含交互项的“full” 回归模型。第二行将完整模型的估计值存储在内存中。“full”这个名字是任意的。我们可以给这个模型的①结果命名任◆何我们喜欢的→名字。第三行拟合了省略交互项的 “reduced” 回归模型。第四行将简化模型的结ㄨ果存储在内存中。
第五步∑ 使用lrtest
计算完整模型与简化模型的 likelihood-ratio test。该检验产生0.4089
的p
值,接近上述回归输出中报告的 Wald 检验。我们不能拒绝交互参数为零的原假设。
您可以↓键入return list
以查看存储在标量r(p)
中的p
值。您可ω 以使用r(p)
来定义reject,就像我们在⌒t
测试程序中所做的那样。
模拟数据和检验回归♂模型的零假设比t
检验稍微复杂一些。但是编写一个程序来自动化这个过程几乎与t
测试▼示例相同。让我们考虑下面的代码块,它定义了程序simregress
。
前三行以capture program
、program
和version
开头,与我们的t
测试程序基√本相同。
该程序『的语法部分与t
测试程序的语法部分类似,但输入参数的名称显然不同。已经包◎含了样本大小、alpha 级别和基本回归参数的输入参数。我们没有为模型中的每个可能的参数都包含一个输入参数,但如果你愿意,也可以这样做。例如,在我们的程序中将变量age
的范围“hard coded”为18
到 65
。但是,如果您愿意,也可以包含︾age
上限和下限的输入参◥数。我还发现包含描述参ζ 数名称的注释很有帮助,这样就不会产生歧︾义。
下一段㊣代码嵌入在一个 “quietly”
的块中。像set obs
、generate
和regress
这样的命令将输出发★送到结果窗口和日志文件(如果你打开了)。将这些命令放在一个quietly
块中会抑制该输出@。
我们已经编写了创建随机数据和检验零假设的命令。因此,我们可以将该代码复制到quietly
块中,并用语法定义的相应本地宏替换任何输入参数。例如,我已将set obs 100
更改为set obs 'n'
,以便观察的数量将由语法指定的输入参∞数设置。我还为输入参数指定¤了与模型中模拟变量相同的名∮称。所以'age'*age
是syntax
定义的输入参数'age'
和模拟生成的变々量age
的乘积。
likelihood-ratio test的p
值存储在标量r(p)
中,我们的程序〓返回标量reject ,与在我们的t测试程序中完全一样。
下面,我使用simulate
运行simregress 100
次并summarized变量reject
。结果表明,给定 100
名参与者的样本和关于模型的其他假设,我们将有16%
的功效来检测√ 0.35
的交互参数。
接下来,我们编写一↑个名为№power_cmd_simregress
的程序,以便我们可以将simregress
集成到 Stata 的power
命令中。power_cmd_simregress
的结构与上一◥篇文章中的power_cmd_ttest
相同。首先,我们定☉义语法和输入参数并指定它们的默认值。然后,我们运行模拟并总结变∮量reject
。之后,我们返回结果。
我们还编写一个名为power_cmd_simregress_init
的程序。回想↓一下上一篇文章,该程序将允许我们为一系列输入参数值运行power simregress
,包括双引号中列出的「参数。
现在,我们已经准备好使Ψ用power simregress
了!下面的输出显示了当interaction
参数等于 0.2
到0.4
时的模拟功效,增量为0.05
,对于大≡小为 400
、500
、600
和700
的样本。
图 1 以图形方式显示了结果。
图 1:回归模型中交互项的估计功效
表格和图表向我们展示了可以产生 80%
功效的几种参数组合。700
名参与者的样本将使我们▓有大约 80%
的功效来检测0.30
的interaction参数。600
名参与者的样本将使我们有▆大约80%
的能←力来检测 0.33
的interaction参数。500
名参与⊙者的样本将使我们有大约80%
的功效来检测大▆约 0.37
的interaction参数。400
名参№与者的样本将使我们有大约 80%
的能力来检测 0.40
的interaction参数。我们对样本大小的选择基于我们想要检测的interaction参数的大小。
此示例侧重于具有两个协变量的回归模■型中的交互项。但是你可以修改这个例子来模拟你能想象到的几乎任何类型的回归模型的能力。在规划模拟时,我建◣议执行以下步骤:
写下感兴趣的回归模型,包括』所有参数。
指定协变量的详细信息,例如age 范围或females比例。
找到或考虑模型中参数的①合理值。
假设替代假№设,模拟单个※数据集,并拟合模ㄨ型。
编写一个程序来创建数据集、拟合模型并使用simulate 来测试程序。
编写一个程序命︻名为power_cmd_mymethod,它允许运行您的power模拟。
编写一个名为power_cmd_ mymethod_init的程序,以便您可以@ 将 numlists 用于所№有参数。
让我们尝试使用这种方法↓进行逻辑回归模型。
逻辑∑回归示例
在此示例中,让我们假设您正计划对hypertension ( highbp )
进行研究。hypertension是二元的,因此我们将使用逻辑回归来拟合模型并使用优势比作为效应大小。
第 1 步:写下模型
模拟功率的首步是写下▲模型。logit(highbp)=β0+β1(age)+β2(sex)+β3(age×sex)
我们需要创建变量highbp
、age
、sex
和交互项age×sex
。我们还需要指定合理的〇参数值β0
,β1
, β2
, 和 β3
.
步骤 2:指定协变量的详细信息
接下来,我们需要考虑模型中的协变量。什么样的年龄值对我们的研究是合理的?我们对老年人感兴√趣吗?年ζ轻的成年人?假∑ 设我们对 18
到 65
岁之间的︻成年人感兴趣。年龄分※布在区间 [18,65]
内是否可』能是均匀的,或者我们是否期望在年龄中间出现驼峰状◎分布范围?我们还需要考虑研究中男性和女性的比例。我们是否可能对 50%
的男性和 50%
的女性进行抽样?这些是我们在规划功率计算时需要问自己●的问题。
假设我『们对 18
到65
岁之间的成年人感兴趣,并且我们相信年龄是均匀分布的。我们还假设样本将是 50%
的女性。一旦★我们为age
和sex
创建变量,就很容易计算交ω 互项age×sex
。
步骤 3:为参数指定合理的值
接下来,我们需要考虑模∑型中参数的合理值。我们可以根据文献综述、试点研究结果或『公开数据来选择参数值。
我选择再次使用 NHANES 数据,因为@它包括变量hypertension ( highbp )
、age
和sex
。
输出模型中每个变量的优势比估计值。优势比是指数参数估计(that is,
),所以我们可以▲指定优势比的自然对数
作为我们功率模拟中的参数。例如,上面输出中年龄的优势比○的估计值为 1.04,因此我们可以指定
我们也可以指定
和
第 4 步:Simulate a dataset assuming the alternative hypothesis, and fit the model
接下来,我们根据我们对替代假◤设下的模型的假设创建ξ 一个模拟数据集。下面的代码块︾与我们用来为线性回归模型创建数据的代码◥几乎相同,但↑有两个重要的区别。首先,我们使用generate xb
创建参数和模拟变量的线性组合。参〓数表示为使用NHANES
数据估计的优势比的自然对数。其次,我们使用rlogistic(m,s)
从变量xb
创建二进制因变量highbp
。
然后,我们可以将⊙逻辑回归模型拟合到我们的模拟数据中。
第 5 步:编写程序以创建々数据集、拟合模型并使用模拟测试程序
接下来,让我们编□写一个程序,在 alternative hypothesis下创建数据集,拟合逻◤辑回归模型,检验零假设,并使用simulate
运行程序的多次迭代。
下面的代码块包含名为simlogit
的程序的语法。语法命令中的默认参数↘值是我们使用 NHANES
数据估计的优势比。我们使用lrtest
来检验ぷ零假设,即age×sex
的优势比等于 1
。
然后,我们使用simulate
默认参数值▓运行simlogit
100 次。
simulate
将假设检验的结果保存到名为reject
的变量中。reject
的平均值是假设样本量为 500 人时,我们估计↑检测age×sex
交互项的优势比为 1.03
的能力。
第 6 步:编写一个名为power_cmd_simlogit
的程序
如果我们只对一组特定的假设感【兴趣,我们可以停止我们》的快速模拟。但是编写一△个名为power_cmd_simlogit
的附加∩程序很容易,它允许我们使用 Stata 的power
命令为一系列样本大小创建表格和→图形。
第 7 步:编写一个名为 power_cmd_simlogit_init
的程序
编写一个名为power_cmd_simlogit_init
的程序也很容易,它允许我们为模型中参数的一系列值模拟功率。
使用power simlogit
现在,我们可以使用power simlogit
来模拟各种假设的功率。下面的示例模拟了一系列样本大@ 小和效果▅大小的功效。样本大№小从400
到 1000
人不等,以 200
为增量。以及age×sex
交互项的优势比范围⊙从 1.02
到 1.05
,增量为 0.01
。
图 2:逻辑回归模型中交互项的估计功效
上面的表格和■图表表明,使用样本大小和效应大小的四种组合可实现 80%
的功效。鉴于我们〖的假设, 我们将至少有 80%
的功效来检测 600
、800
和 1000
的样本量的优▽势比为 1.04
。我们将有80%
的功效来检测1.05
的优势比,样本量为 400
人。
在这篇文『章中,我们展示了如何在线性和逻辑回◆归模型中模拟交互项的统计功效。您可以根据自己的目→的修改上面的示例。
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