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                DNA甲基化和拷贝数改变对microRNA表达影响

                教育装备采购网 2013-11-26 09:25 围观465次

                  microRNA(miRNA)是一类小的非编码rna分子,它通过控制mRNA稳定性和翻译而在转录后水平上调控基因表达。之前的研究发现,miRNA在癌症中往往异常表达。在乳腺癌中,miRNA表达的改变与雌激素受体(ER)信号通路、增殖和转移相关联。然而,miRNA表达异常的潜在机制还不太清楚,可能的原因有DNA拷贝数改变、突变、表观遗传改变等。

                  为了了解乳腺癌中拷贝数和甲基化对miRNA表达的影响,奥斯陆大〓学K.G. Jebsen乳腺癌研究中心的Vessela N Kristensen领导的研究小组整合了全基因组的DNA甲基化、拷贝数和miRNA表达,以鉴定miRNA失调背后的遗传机制。

                  研究人员利用安捷伦的8x15k miRNA芯片,开展了89个原发性乳腺癌样本的miRNA表达谱分析。DNA甲基化分析使用的是Illumina的Infinium HumanMethylation450 BeadChip芯片,而DNA拷贝数分析则用的是Illumina Human-1 109k BeadChip SNP芯片。

                  通过这一系列分析,他们〇鉴定出70个miRNA,其表达与拷贝数或甲基化的改变相关,或与两者都相关。这些miRNA代表了5个miRNA家族。有趣的是,这些家族的成员编码在不同的染色体上,在甲基化不足或甲基化过度时互补改变。

                  在随后的验证研究中,研究人员分析了另123名乳●腺癌患者的miRNA表达和拷贝数数据。他们发现,在这70个miRNA中,41个的表达变化模式经过确认。之后,研究人员在三个乳腺癌细胞系中开展了体外功能实验,用miRNA模拟物来评估其功能意@义。他们发现了4个miRNA(miR-21-3p、miR-148b-3p、miR-151a-5p和let-7e-3p),其中let-7e-3p在肿瘤中与甲基化不足相关,它诱导凋亡并降低细胞活力,而let-7e-3p低表达与预后不良有关。其他三个miRNA的过表达与拷贝数增加相关,会增加乳腺癌细胞系的增殖。此外,miR-151a-5p提高了磷ξ 酸化AKT蛋白的水平。

                 

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