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                中外科学家Nature发表单细胞测序新成果

                教育装备采购网 2013-08-06 13:59 围观401次

                  来自同济大学医学院、南京医科大学和加州大学洛杉矶分校的科学家们,利用强大的单细胞RNA测序技术以前所未有的精确水平,追踪了人类和小鼠胚胎的遗传发育。该技术使得研究人员能够更早及更准确地诊断遗传病,即便是在8细胞期。

                  同济大学医学院的薛志刚(Zhigang Xue)博士、南京『医科大学的刘嘉茵(Jia-yin Liu)教授及加州大学洛杉矶分校的人类遗传学和分子生物学教授范国平(Guoping Fan)为这篇论文的共同通讯作者。研究结果●在线发表在《自然》(Nature)杂志上。

                  单细胞RNA测序使得研究人员能够确∮定在某一特定细胞中全部基因转录物的精确状态,或是所有活性表达的基因。范国平说:“该技术具有双重优点。它能够实现比以前更为全面的分析,并且该技术只需要非常少量的样本材料——1个细胞。”

                  除ξ了用于遗传诊断,提高科学家们鉴别如BRCA1和BRCA2(导致妇女易罹患乳腺癌和卵巢癌)等遗传突变的能力,或是确诊由蛋白质功能障碍引起的遗传疾病,如镰状细胞病的能力,该技术还能在生殖医学中发挥重要的用途。

                  该技术标志着遗传诊断的一个重要进展,从前在胚胎发育的早期无法进行遗传诊断,且需要更大量的生物学材料。

                  在新◥研究中,科学家们利用单细胞表达谱研究的RNA-seq技术,突破了起始样本量少的瓶颈,对人胚胎早期发育各阶段全基因组RNA转录谱进行了系统分析,发现在胚胎发育早期各◥阶段中存在着父亲或母亲来源的单等位基因表达差异。

                  同时运用加权基因共表达网络分析(WGCNA)显示胚胎早期发育各阶段中的细胞周期、基因调控、蛋白质翻译↑以及代谢通路的转录变化是以分步进行的方←式按顺序发生,并明确了该↘机制在物种间保守存在,仅在发育特异性和时序上有所差异,证明了哺乳动物早期胚胎发育进化上的共性。此外,该研究还发现了驱动胚胎早期发育各阶段的关键候选基因。

                  论文的共同第一作者、范国平实验室博士后学者Kevin Huang说:“在这篇论文之前,我们对于早╲期人类发育并不十分了解。现在我》们可以定义其‘正常’的样子,因此为了我们将以此为基准,对照出可能的遗传问题。这是我们第一次全面略看正常的情况。”

                  利用单细胞RNA测序,检测到了比从前多得多的基因转录。范国平说:“我们的问题是,‘这一基因网络是如何驱动早期发←育从1个细胞到2个细胞,从2 个细胞到4个细胞,以此类推的?’利用共同作者、加州大学洛杉矶分校Steve Horvath开发的基因组数◆据分析方法,我们揭示了重要的基因网络,并且我们现在可以在8细胞期预测未来可能的遗传疾病。”

                  这项研究获得了中国科技部、中国国际科学技术合作项目和中ζ国国家自然科学基金的支持。

                来源:生物通 我要投稿
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