当前，基因测序仪的主要生产企业有Illumina、Life technologies、Pacific Biosciences等。近日，仪器信息≡网编辑随机采访了基因测序仪用户，所采访用户涉及〗高校、科研院所、测序公司的实验室等，共计3名用户，其中A用户使用Life technologies 公司产品ABI 3730XL，主要应用于PCR产物测序，质粒和细菌人工染色体的末端测序;B用户使用Illumina公司推出的 hiseq-2000，主要应用基因组组装、重测序、外显子测序、转录组测ω　序以及小RNA测序的研究;C用户使用Pacific Biosciences公司▅研发生产的PacBio RSI，主要应用于基因组从∏头测序，检测DNA修饰。仪器信息网所采△访的产品涵盖了第一、第二和第三代基因测序仪。

　　ABI 3730XL测序仪

　　Illumina hiseq-2000测序仪

　　PacBio RSI 测序仪

　　仪器价格：一代更比一代高

　　在采访中了解到，用户A所使用的ABI 3730XL测序仪购于2010年，当时购买的价格是100万元人民币〓左右，这是◎一款第一代测序仪，其基于毛细管电泳和荧光标记技术进︽行测序。

　　用户B使用的第二代测序仪Illumina hiseq-2000于2011年购买，价格约为75万美元，其采用可逆终止法的边合成边测序技术。

　　用户C使用的PacBio RS I测序仪是一款第三代测序仪，其利用DNA单分子的直接测卐序的原理进行测序。该仪器于2012年购进，当时购买价格约为¤100万美元。

　　用户开机率：普遍较高

　　A用户来自测序公司，每天＠都收到来自其他单位的测序样本，因此使用频率非常高，几乎每天都开机，

　　B用户来自科研机构，该仪器作为平台仪器，为单位所在的整个科研系统服务，两年中都是满负荷使用。

　　C用▲户来自高校，仪器主要为高校内部系统々提供服务，1年中使用频率较高。

　　测序速率，读长，通量都可◣以满足需求

　　相比之下，ABI 3730XL测序仪的测序速度在第一代基因测序仪中是最高的。但是，由于其依赖于电泳分离技术，所以速率方面难以进一步升级，96样本的测序运行█时间约为1小时40分钟。每天的数据通量可以达到600000bp，主要适合于基因测序和基因分型研究。

　　Illumina hiseq-2000测序仪作为第二代◣测序仪，测序速率大大提升，每天最高可以产生75Gb的数据。可以实现De Novo从头测序，DNA重测序等各种测序目标。

　　PacBio RSI的测序速度可以达到每分钟60个碱基，从样品制备到获得碱基序列的全部流程可在1天内完成。每天可获得的〒数据是200Mb mappable data。能够完成≡各种测序目标。

　　读长方面，ABI 3730XL的准确读长可以达到800bp。Illumina hiseq-2000测序仪读长可以达到2×100bp。PacBio RSI目前可以获得∞1300bp的平均读长。

　　前处理环节：第三代测序仪㊣　优势明显

　　用户表示，ABI 3730XL和Illumina hiseq-2000虽然与同类仪器相比建库准备实验相对方便，但仍需花费较长时间和大量人力。但作为第三代测序▆平台的PacBio RSI测序仪，利用DNA单分子的直接测序的原理，无需进〇行文库制备，可直接从DNA片段获得测序数据，从样本制备到获得测序结果，所需的时间还不到一天。并且与传统标准方法相比，所需的DNA量也△相当少，用量可◇低至不到500ng。

　　收费售后服务№：用户满意度高

　　Illumina、Life technologies的售后服务获↑得了用户的一致认可，用户认为，其服务“响应速度快，专业性高，解决问题十分彻底”。

　　基因测序仪的产品生产商相对较少，过了免费的质保服务期之后，用户需要承担高额的╳售后服务费用，但几名用户对此并未产生不满，ABI 3730XL的用⌒户表示，“我们认为一年▲10万元的售后费用物有所值。”

　　改进意见：配套试剂耗材应降价

　　尽管ABI 3730XL在速度和成本方面都已达到了极限，但与二三代测序仪相比，其通量较低，成本较高，并且由于其对电泳分离技术的依赖，速度成本难以进一步提∩升。尽管如此，ABI 3730XL用户认为，ABI 3730XL方法可靠，并且已形成♀规模化，将继续发挥重要作用。

　　使用Illumina hiseq-2000的用户认为∑　，该仪器的配套试剂价格过高，另外读长还有待增加，并且希望建库准备实验可以实现自动化。

　　PacBio，RSI的用户表示，这台仪器★的不足之处主要在于试剂耗材价格过高，通量还有待提⊙高。另外，PacBio RSI系统可『购买升级包，将原有系统转化成最新的PacBio RSII，但是，升级耗资巨大也是令用户头痛的问题。

　　附：基因测序仪简介

　　DNA测序技术是现代生物学研究中重要的研究手段之一。成熟的DNA测序技∞术始于20世纪70年代中期。1977年，Maxam和Gilbert报道了∮通过化学降解测定DNA序列的方法。同一时期，Sanger发明了双脱氧链终止法。20世纪90年代，荧光自动测①序技术将DNA测序带入自动化测序时代。目前，基因测序仪已发展到第三代，Illumina、Life technologies(ABI)等公司共同占据着全球基因测序仪市场。