随着信息技术和计算机辅助药物发现手段的不断进步,应用于药物发现阶段的计算模拟工具已经跨越了只能少数计算化学专家才能使用的阶段,逐步成为在计算化学家指导和辅助下的实验药物化々学家的日常应用工具。作为“集成化的药物发现计算模拟平台”的一个重要组成部分,Discovery Studio计算模拟工具,提供包括基因表达,药物◤靶标的确认及结构和功能的合理预测、丰富和精确的分子对接工具、基于药效团和定量构效关系的先导化合物设♀计和优化、药物的代谢、吸收、分布、分泌和毒︾理(ADME/T)性质的预测等丰富的计算模拟工具。Discovery Studio可□以让计算化学家应用这些工具,在药物发现的各个阶段,深入地了解药物靶点的结构与功能的关系、药物配体与受体之间的作用机理,进而建立和验证合理的①分子对接、药效团、定量构▓效关系以及ADME/T的预测模型←,指导在药物发现阶段的虚拟筛选以及先导化合物的设计和优化。
而作为“集成化的药物发现计算模拟平台”的另外一个重要组成部分,Pipeline Pilot基于流程化的信→息挖掘、分析和管理工具,可以帮助计算化学家将№建立并经过验证过的分子对接、药效团、定量构效关系以及ADME/T的预测模型↓以流程化结合浏览器(Web)界面的方式发布给实验药物化学家。实验药物化学家可以在日常的实验工作中,通过浏览器便可以方便的进行合成库设计、利用这些预测模型对合成库以及外部和内部的化合物数据库进行虚〖拟筛选以及进行先导化合物的设计和优化,以达到缩『短药物发现的时间、节省研发成本、提高研发水平的目的。
作为“集成化的药物发现计算模拟平台”最后一个关键的组成部分,基于ISIS化学信息管理系统所能够提供的⌒ 内部及外部的化合物结构与活性数⌒ 据库,是对这一计算模拟平台最重要的数据支持系统,计算化学家可以利用这些数据来构建相应的预■测模型,而实验药物学家可以利用这些数据进行虚拟筛选来寻找候选的先▼导化合物。