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                t-RAS(转录组可变剪接调控深度分析)

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                t-RAS(转录组可变剪接调控深度分析)

                        本公司采用自主研发与成熟开源软件相结合的方式构建了︻专业高效的生物信息分析流程,对您获得的海量RNA-seq序列▼的质量、特征等重要信息进行△图形可视化;根据对照和实验组,系统分析您样品中所蕴藏的可变剪接㊣调控规律,中肯分析所揭示出的重要科学规律;让您快速“发现”所关注的生物学,医学和农业问题的答案。
                        “两个生物学样品”指从两种具有确定差异的细胞中所获得的样品。
                我们的流ぷ程:
                1.       Pretreatment(有效序列Reads提取)
                • 高通量测序质量评ξ 估,获得测序有效读长。
                • 剔除每条序列中的index序列和adaptor序列。
                • 获得有效序列总◥数。
                1.       Mapping (全基因组定位):让您看见自己样品中mRNAncRNA的分布状态。
                • Reads mapping: total mapped, unique mapped, multiple mapped.
                • Genomic distribution of the mapped reads。包括基因不同区▓域分布分析:
                (1) 5’UTR,CDS,3’UTR,intron and intergenic region
                (2) sense and antisense region
                (3) mRNA and ncRNA region
                1.       mRNA coverage analysismRNA覆盖度分析):让您看见自己样品中mRNA的质量和特征。
                • 盒须◣图分析mRNA不同区的reads coverage,以intron区作对照。
                • Reads 在均一化的mRNA上№的分布图。
                1.       Expression analysis (mRNA 表达▅量分析):让您看见自己样品中每个基因的表达量。
                • 通过严格的标准化获得您样品中每个基因的可信表达╱丰度。
                • 根据表达丰度对您样品中的基因分布趋势进行可视化。
                1.       Analysis of the regulated alternative splicing (可变剪接调控♂分析)让您快速“发现”样品中可变●剪接模式的变化,及其所介导的基因表达变化;“认清”可变剪接调控在你所感兴趣生物学、医学和农业』问题的重要贡献。
                针对您的实ξ验组和对照组中:
                 
                • 分析可变剪接变化的整体模式和每一〓类可变剪接变化的模式。
                •  “察清”可变剪接对基因表达水平和所编码蛋白性质的潜在影响。
                • 对可变剪接发生显著变化的基因进行功能聚类分析。
                • 结合您的前期研究成果和您研究领『域的进展,给出您新的科学发现。
                1.       为客户提供验证新AS的实验方↘案
                2.       为客户提供验证新科学发现的实验方案。
                我们的承诺:
                • 提交您专业的项目╲结题报告。
                • 一个生物学样》品分析完成时间一般为5-7个工作日,每加一个样本增加2-3个工作日。
                您需要提供的样品:
                • 如果您的RNA-seq过程不是在本公司完成,请您提供原始测序数据,样品介绍,以及您的项目需求。
                • 分析结果的可信度和深度依赖⊙于您的测序质量和有效reads的数量。
                • 高度推荐75-nt以上的序列。
                当您的需求不在我们现有的基◇因组分析产品内♂时:
                        我们愿意竭诚针对您特殊的业务需求,为您提供量身定做的个性化服务。您的要求和我们满足您要求的技术方案等将在国家科技部规范的“技术开发(委托)合同”中一览无遗。相信我们的专业化高端技术服务会让您所有〓的基因组数据闪闪发光。

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