SimGlycan多糖质谱』数据分析软件主要功能特点:
强大的多糖和糖肽数据库
SimGlycan 数据库是一个巨大的关系数据库,包含22,456种多糖、22814种糖肽、11,438种已知生物来源的多糖、11,918种已知分类的多糖、 263种生物化◆学反应、194种生化通路、250种酶相关多糖和9521个其他数∑据库链接。随着其他多糖信息的公布,数据库不断更新。
产√生注释的图谱
SimGlycan 突出符合理论裂解的实验质核比值,产生描述连续单糖单位减少的注释的图谱。这有助于研究者建立支链类型,验ω 证多糖的基本单位。每个峰可 用动画或Domon Costello命名法代表。可产生适合页面大小或々基于目标区域的定制化的注释图谱,输出并与他人分享。简单的界面可以放大进入特定图位,指定质☉核比范围 来显示特定的图谱部分,也可以以图像文件输出到MS PowerPoint。
用户绘制结构
SimGlycan 允许用户绘制和编辑多糖和糖↘肽。单糖、肽链或如HSO3和Etn的取代基可以添加或删除,分支点和端基连接(anomeric linkage)可点击按键来修饰。每步,绘制结构的裂解使用户可以比较∩实验和理论数据,用户可见该修饰是否使理论上的多糖更接近于◢实验数据。这一功能对 解析多糖结构有很大帮助,特别是在ζ没有目标多糖数据的情况下。
精确的多糖排序
基于我们专有的研究和评分机制对所有可♂能的多糖进行排序和打分。排序机制ζ 基于对多糖分数的计算,该分数是一个数值,代表多糖的实验属性(组成和分支类型)与数据库中多糖的属性的接近程度。