培训时间:2017年12月7-8日(周四至周五)
培训地点:苏州创腾科〓技培训中心〓(江苏省苏州市工业园区东长路88号2.5产业园A2栋301室)
?培训主旨:
抗体药物作为生物药物的主力军,以其高特异性、有效性和安全性正在发展成为国际药品市场上一大类新型诊断和治疗药物,日益成为许多重要疾病(癌症、慢性炎症疾病、心血管疾病、免疫系统疾病等)治疗市场的新宠。而分子模拟技术在近20年内已两次荣登诺贝尔化学奖的奖台,成为生命科学领域认识和解决复杂的科学和工程问题的重要方法。借助分子模拟技术进行抗╳体药的理性设计已成为未来治疗性抗体研发新趋势,其重要作用也越来越多的¤得到体现。Discovery Studio作为面向生命科学领域的分ξ子模拟与分子设计软件,不仅可以为抗体研发者们提⌒ 供一个易于操作使用的抗体建模环境,而且还可以以抗体结构作为起点,优化抗体作为治疗性药物的疗效和药物可发展性,从而助力抗♂体新药研发,提高抗体成药性,加速抗体研发■周期,降低研发成本。本次培训班旨在帮助学员系统了解、掌握如何应用Discovery Studio进行抗体理性设计并快速上机操作。
?培训对象:
从事抗体药★物研发相关领域的科研工作者,以及有兴趣想要借助Discovery Studio分子模拟平台来开展抗体理性设计工作并能快ㄨ速上机模拟操作的相关人员。
?培训内容:
本次培『训主要以Discovery Studio软件为依托,详细介绍DS在抗体理性设计领域提供的一系列完美解决方案与上机操作,内容包括:
- 抗体序列的注释:抗体重链及轻链可变区、恒定区、CDR区的注释,抗体Gemline基因的识别;
- 抗〓体序列的分析:抗体翻译后修饰位点的预测(如♂糖基化位点等),抗原线性表№位预测;
- 抗体结构的预测与优化,全长抗体、抗体Fab区、scFv结构的预测,抗体人源化▃改造;
- 抗体-抗原相互作用的预∑测,抗原构象表位的识别;
- 抗体分子的设计与改→造:抗体亲和力成熟,抗体稳定性优化,双特异性抗体设计,抗体聚集效应分析▂。
?培训形式:
1、通过文献案例╱分析讲解抗体理性设计策略,以及相应功能模块的原理介绍;
2、上机操作:讲解抗体理性设计过程中每一步骤的具体操作流程及参数设置(提供完整的培←训教程);
3、学员交流与讨论,工程师进行现场】答疑答疑。
?课程安排:
第一天
08:30-09:00
报到和注册
报到地点:苏州创腾培训中心
09:00-10:30
Discovery Studio基本界面
DS背景介绍,DS界面介绍,DS入门操作,
抗体、抗原分子的预处理方法介绍与实际操作。
10:30-10:45
茶歇
10:45-11:45
抗体理性设计概述
抗体理●性设计专题之一:抗〓体序列的分析
基于抗体序列注释々抗体结构域和CDR loop区,识别Gemline基因,预测PTM翻译后修饰位点、抗原线性表位。
11:45-13:30
午餐
13:30-15:00
抗体理性设计@ 专题之二:抗体结构的预测及优化、抗体人源化
抗体Fab区、Fv区、scFv、全长结构及双特异性抗体结构的构建,CDR区的优化,抗体人源化改造策略,基本原〒理介绍及案例分析。
15:00-15:15
茶歇
15:15-16:30
抗体理性设计专题之二:抗体结♀构的构建及优化、抗体人源化
抗体建模参数设置、实际操作技巧及结︻果分析。
16:30-17:15
课程讨论及答疑
第二天
09:00-10:15
抗体理性设计专题之ξ 三:抗体-抗原相互作用预测(CDOCKER)
抗体、抗原结合模式的确定,结合表面关键残基的分析,抗原表位的识※别。
基本原№理介绍及案例分析、参数设置、实际操作技巧及结果分析。
10:15-10:30
茶歇
10:30-11:45
抗体理性设计专题之三:抗体-抗原相互作用预测(ZDOCK)
抗体、抗原结合模式的确定,结合表面关键残基的分析,抗原表位的识别。
基本』原理介绍及案例分析、参数设置、实际操作技巧及结果分析。
11:45-13:30
午餐
13:30-14:15
抗体理性设计专题之四:抗体亲和力成熟(虚拟↑氨基酸突变扫描)
虚拟氨基酸扫描突变,识别能够优化抗体↘结合亲和力的突变位点,pH和温度等环境因素的考虑。
基本原理介绍、案例分析、参数设置、实际操作技巧及结果分析。
14:15-15:00
抗体理性设计专题之五:抗体稳定性优化(虚拟氨基酸突变扫●描)
虚拟氨基酸扫描突变,搜索能够稳定抗体结构的突变位点,抗体人源化过程中影响稳定性的back mutation位点的Ψ 分析。
基本原理介绍、案例分析、参数设置、实际操作技巧及结果分析。
15:00-15:15
茶歇
15:15-16:30
抗体理性设▲计专题之六:抗体稳定性优化(抗体聚集效应的预测)
识别抗体结构中易于聚集的位点以进行突变优化,以抗体▃聚集效应作为指标评价抗体的稳定性和可发展性以筛选在研抗体。
基本原理介绍、案例分析、参数设置、实际操作技巧及结果分析。
16:30-17:15
课程讨论及答疑