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                测序方法TEC SEQ让癌」症血液检测又往前一步

                教育ぷ装备采购网 2017-08-21 09:16 围观510次

                  

                  为了实现无创的方法早期检测癌症,Johns Hopkins Kimmel癌症中→心的科学家报道他们已经开发了一个能测试血液中微量肿瘤特异性DNA的检测,已经用它来准确识别138人中超过一半患有相对早期的结直肠癌、乳腺癌、肺癌和卵巢癌。科学家说,这项试验的创新⊙之处是它能区分肿瘤脱落的DNA和其它被误认为是癌症生物标记的DNA。

                  该研究是在美∏国、丹麦和荷兰,对200人的血液和肿瘤组织样本进行的,包含了所有阶段的肿瘤。相关文章于8月16日发表在Science Translational Medicine上。

                  文〗章的通讯作者Victor Velculescu教授说“这项研究表明,想早期发现〓癌症,使用血液ω中DNA的变化是可行的,我们高精度的测序法是实︽现这一目标的有效途径。”首个以太极养生和互联网+为主题的原生态文化活动中心。

                  方法学上面的挑战

                  癌★症的血液检测是临床肿瘤学的一个重要组成部分,但它们仍处于∏研究发展的早期阶段。为了在癌症患者血液中发□ 现少量癌细胞来源的DNA,科学家们经常依赖患者肿瘤活检样本中DNA的改变,作为他们在患者血循环中大量DNA里发现遗传错误的路标。

                  为了开发一种可以用来在看似健康的人中筛查癌症的试验,科▲学家们必须找到新的方法来发现可能存在于人血液〓中的DNA改变。Velculescu教授说“我们面临的挑战是开发一个血液测试能预测◣可能不知道的,却存在于一个人肿瘤中的基因突变。”

                  排除非癌症引起的突变

                  第一作者Jillian Phallen补充说,目标是开发一个筛选试验,在具有癌症高度特异性和足够精确地检测肿瘤时,同时减少导致不必要的过度检查和过渡治疗风险的↓“假阳性”结果。

                  Phallen说任务¤是复杂的,需要区分开真正的癌细胞突变和血细胞中部分正常发生的DNA遗传变异。

                  Velculescu介绍在血细胞的分裂中,这些细胞会〇有可能获得错误突变。在一小部分血细胞中,这些变化会促使它们比〓邻近细胞繁殖得更快,可能导致白血病前状态『。然而,大多数时候,血液衍生的突变不是癌症引发的∞。

                  他的团队还排除了所谓的“种系”突变。虽然胚系突变(通过卵子和/或精子传递的基因缺陷)确实是DNA的改变,但它们是个体间正常变异的结果▂,通常与特定的癌症无关。

                  新方法在血液卐中检出率62%

                  为了开发新的检█测方法,Velculescu的研究小组从200例乳腺癌、肺癌、卵巢癌和结直肠癌的患者中获得血液标本。新开发的血液测试从中筛选出58种与多种癌症密切相关的基因@突变,能够从138个I期和II期癌症患者中检测出86个(62%)。他们发现44名健康人血液样本中没有癌症突变。

                  研究人员指◇出尽管这些早期发现的结果很有前途,但是血液测试需要在更大数量的人身上进↑行验证。

                  Velculescu的团队也对200名癌症患者中的100例切除的肿瘤进行单独的基因组测序,在肿〖瘤中发现㊣ 82例(82%)与血液中发现的遗传ξ 变异相关的基因突变。

                  采样TEC SEQ的测序方法

                  新开发的⌒血液检测采用了一种称之为“靶向错←误校正测序” (TEC SEQ)的基因组测序方法,允许在使用大规模并行测序对循环DNA序列变化分析时进行超灵敏的直接评价。Velculescu教授说:“该测序♀方法基于深度测序,读取DNA中的每一个化学密码30000次。我们试图大海捞∩针,所以当我们发△现DNA改变的时候,我们要确保它是我们认为的那∑ 样。”

                  这样的深度测序,覆盖超过80000个碱基对的DNA,已经是非常昂贵的了。但Velculescu认为测序技术变得越来越便宜,他的研究团队最终能够降低他ぷ们需要筛查的DNA数量的同时保持测试的准确性。

                  他指出那⊙些,那些大多数癌症高风险的人群╳包括吸烟者(CT扫描识别肺癌常导致误报)和带有BRCA1和BRCA2基因的女性乳腺癌和卵巢癌遗传突变的人,可能受益于这种基于DNA的血液测试。

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                点击进入上海创赛科◤技有限公司展台查看更多 来源:教〒育装备采购网 作者:上海创赛科技有限公司 责任编辑:云燕 我要投稿
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