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                免疫共沉淀试剂配制及技术路线

                教育装备采购网 2015-05-12 09:07 围观596次
                实验试剂 1. RIPA Buffer配制基础成分:Tris-HCl(缓冲液成分,防止蛋白变性)NaCl(盐份,防止非特异蛋白聚集)NP-40(非离子№去污剂,提取蛋白;用H2 O配制成10%储存液)去氧胆酸钠(离子去污剂,提取蛋白;用H2 O配制成10%储存液;避光保存)注意:准备激酶(致活酶)实验时,不要加去氧胆酸钠,因为离子型去污剂能够使酶变性,导致活性丧失。RIPA蛋白酶抑制剂苯甲基磺酰氟(PMSF)(用异丙醇配制成200mM的储存液,室温保存)EDTA(钙螯合剂;用H2 O配制成100mM的储存液,PH7.4)亮抑酶肽(Leupeptin)(用H2 O配制成1mg/ml的储存液,分装,-20℃保存)抑蛋白酶肽(Aprotinin)(用H2 O配制成1mg/ml的储存液,分装,-20℃保存)胃蛋白酶抑制剂(Pepstatin)(用甲醇■配制成1mg/ml的储存液,分装,-20℃保存)RIPA磷酸(酯)酶抑制剂激活的Na3 VO4 (用H2 O配制成200mM的储存液)NaF(200mM的储存液,室温保存)注意:在准备做磷▽酸(酯)酶实验的时ω 候,不加磷酸酯酶抑制剂2. 工作液配制配制100ml的modified RIPA buffer: 1) 称取790mg 的Tris-Base,加到75ml 去离子水中,加入900mg的NaCl,搅拌,直到全部溶解,用HCl调节PH值到7.4 2) 加10 ml 10%的NP-40 3) 加2.5 ml 10%的去氧≡胆酸钠,搅拌,直到溶』液澄清 4) 加1 ml 100mM的EDTA,用量筒定容到100ml,2-8℃保存 5) 理论上,蛋白酶和磷酸酯酶抑制剂应该在使用当天同时加入(抑蛋白酶肽,亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制剂各♂100 μl; PMSF,Na3 VO4 ,NaF各500 μl),但是PMSF在水溶液中很不稳定,30分钟就会降解一半,所以PMSF应◥该在使用前现加,其他抑制剂︾成分可以在水溶液中稳定5天。各种成分在工作液中的终浓度: a. Tris-HCl:50 mM,pH 7.4 b. NP-40:1% c. 去氧胆酸钠:0.25% d. NaCl:150 mM e. EDTA:1 mM f. PMSF:1 mM g. 抑蛋白酶肽,亮抑酶肽,胃蛋白酶抑制剂:各1 μg/ml h. Na3 VO4 :1 mM i. NaF:1 mM实验步骤 准备工作:1. 预冷PBS,RIPA Buffer,细胞刮子(用保鲜膜包好后▂,埋冰下),离心机;2. 用预冷的PBS洗涤细胞两次」,最后一次吸干PBS;3. 加入预冷的RIPA Buffer(1ml/107 个细胞、10cm培养皿或150cm2 培养瓶,0.5ml/5×106 个细胞、6cm培养皿、75cm2 培养瓶);4. 用预冷的细胞刮子将细胞从培养皿或培养瓶上刮下,把悬液】转到1.5EP管中,4℃,缓慢晃动15min(EP管插冰上,置水平摇床上);5. 4℃,14000g离心15min,立即将上清转移到一个@ 新的离心管中;6. 准备Protein A agarose,用PBS 洗两遍珠∩子Ψ,然后用PBS配制成50%浓度,建议减掉枪尖▆部分,避免在涉及琼脂糖珠的操作中破坏琼脂糖珠;7. 每1ml总蛋白中加入100μl Protein A琼脂糖珠(50%),4℃摇晃10min(EP管插冰上,置水平摇床上),以去除非特异性杂蛋白,降低背景;8. 4℃,14000g离心15min,将上清转移到一个新的离心管中,去除Protein A珠子;9. (Bradford 法)做蛋白标△准曲线,测定蛋白浓度,测前将总蛋白至少稀▓释1:10倍以上,以减少细胞裂解液中去垢剂的影响(定量,分装后,可以在-20℃保存一个月);10. 用PBS将总蛋♀白稀释到约1μg/μl,以降低裂〓解液中去垢剂的浓度,如果兴趣蛋白在细胞中含量较低,则总蛋白№浓度应该稍高(如10 μg/μl);11. 加入一定体积的兔抗到500μl总蛋白中,抗体的稀释比例因兴趣蛋白在不同细胞系中的多少而异;12. 4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温2h,激酶或磷酸酯酶活性分析建议︻用2 h室温孵育;13. 加入100μl Protein A琼脂糖◆珠来捕捉抗原抗体复合物,4℃缓慢摇动抗原抗体混合物过夜或室温1h,如果所用抗体为鼠抗或鸡抗,建议加2 μl“过渡抗体”(兔抗鼠IgG,兔抗鸡IgG);14. 14000rpm瞬时离心5s,收集☆琼脂糖珠-抗原抗体复合物,去上清,用预冷的RIPA buffer洗3遍,800μl/遍,RIPA buffer有时候会破坏琼脂∮糖珠-抗原抗体复合物内部的∴结合,可以使用PBS;15. 用60μl 2×上样缓冲液将琼脂糖珠-抗原抗体复合物悬√起,轻轻混匀,缓冲液的量依据上样多少的需要¤而定(60 μl足够上三道);16. 将上样样品煮5min,以游离抗原,抗体,珠子,离心,将上清电泳,收集剩余琼●脂糖珠,上清也可以卐暂时冻-20℃,留待以后电泳,电泳前应再次煮5min变性。通过免疫共沉淀确定结合蛋白:1. 用磷酸盐缓冲液洗30块10 cm培养板上的▲适宜细胞。刮去每块板※上的细胞到1 ml冰冷的EBC裂解缓冲液中;2. 将每毫升细胞悬液々转移到微量离心管中,在微量离◥心机上4℃以最大速度离心15 min;3. 收集上清(约30 ml)并加入30μg的适当抗体,4℃摇动免疫沉淀物1 h;4. 加入0.9 ml的蛋白质A-Sepharose 悬液,4℃摇动免疫沉淀物30 min;5. 用含900 mmol/L NaCl的NETN洗蛋白A-Sepharose混合物,再重复洗5次。最后,用NETN洗一次;6. 吸出混合物↙的液体部分。加入800μl的1×SDS胶加■样缓冲液到球珠中,煮沸4 min;7. 将样品加入到大孔的不连续SDS-PAGE梯度胶中,在10 mA的恒定电流下【电泳过夜;8. 通过考马斯蓝染色观察蛋白质泳带;9. 从胶上切下目标带,将其放到微量离心管中,用1ml 50%乙腈洗两〖次,每次3 min;10.用胰蛋白酶消化胶中的蛋白质,再将」肽电洗脱;11.通过窄孔高效液相色谱分离肽。将收集的肽在ABI 477A或494A机器上进行自动Edman降解测序。
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