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2月份共新增7个应用案例:
一、腺苷酸环化酶关联蛋白1(CAP1)与人♀抵抗素作用机制研究;
二、BTG3抑制肿瘤机制的确定及抗肿瘤短肽的设计;
三、灵芝菌属各有效组分的靶标的搜寻;
四、探索青色素化合物作为蛋白质精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)选择性抑制剂的研究;
五、细胞周期蛋白结々合槽肽向具有抗肿瘤活性的CDK抑制剂转化∮研究
六、为抗体可变区建模预测VH-VL的结构取向;
七、基于系统数据驱动的分析方法识别抗癌药▲物化学物质的结构特点
具体案例简介及查看链接:
案例名称 | 腺苷酸环化酶关联蛋白1(CAP1)与人抵抗素作用机制研究 |
参考文献 | Cell Metabolism 19, 484–497, March 4, 2014 IF=16.747 |
软 件 | Discovery Studio |
研究方向 | 计算生物学 |
简 介 | 本文采用同源∮建模、分子对接、动力学模拟等方法,研究了腺苷酸环化酶关联蛋白1作为人抵抗素潜在受体的分子作用机制,同时通过定点突变技术对腺苷酸环化酶关联蛋白1作□为潜在靶标治疗肥胖、动脉硬化等疾病的可能性。 |
案例名称 | BTG3抑制肿瘤机制的确定及抗肿瘤短肽的设计 |
参考文献 | Cell Death and Disease (2015) 6, e1584 IF=5.177 |
软 件 | Discovery Studio |
研究方向 | 药物设计 |
简 介 | 通过分子模拟的方法对BTG3抑制肿瘤机制进行解释和说明,并对C5-C抗肿瘤短肽的作用机制的解释和关键氨基酸的确定。 |
案例名称 | 灵芝菌属各有效组分的靶标的搜寻 |
参考文献 | Phytochemistry xxx (2014) xxx–xxx IF=3.35 |
软 件 | Discovery Studio |
研究方向 | 药物设计 |
简 介 | 本文利用药效团模型,确定了灵芝中个有效成分的可能的作用╳的靶标,从而确定各组分发挥的生理活性,并从分子水平上对可能的作用机制进行解释和说明。 |
案例名称 | 探索青色素化合物作为蛋白质精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)选择性抑制剂的研究 |
参考文献 |
J. Med. Chem., Articles ASAP, Publication Date (Web): January 5, 2015 (Article) . IF=5.48 |
软 件 | Discovery Studio |
研究方向 | 药物设计 |
简 介 | 蛋白质精氨酸甲基转移酶1(PRMT1)的过表达异常与肿瘤、肾病、心血管系统疾病等密切相关。本文结合分子模拟探索了青色素化合物作为PRMT1选择性抑制剂的购销关系和作用机制。 |
案例名称 | 细胞周期蛋↓白结合槽肽向具有抗肿瘤活性的CDK抑制剂№转化研究 |
参考文献 | J. Med. Chem., 2015, 58 (1), pp 433–442. IF=5.48 |
软 件 | Discovery Studio |
研究方向 | 药物设计 |
简 介 | 细胞周期蛋白通过同细胞周期蛋白依赖性激酶的结合来调∏节其酶活性,从而推动和协调细胞周期的进行。细胞周期蛋白结合槽是CDK抑制剂非ATP竞争性抑制位点。本文结合模拟研究了如何将细胞周期蛋白结合槽肽转换为具有抗肿瘤活性『的非肽类CDK类药抑▽制剂。 |
案例名称 | 为抗体可变区建模预测VH-VL的结构取向 |
参考文献 | Proteins: Structure, Function and Bioinformatics DOI10.1002/prot.24756 IF:2.921 |
软 件 | Pipeline Pilot |
研究方向 | 抗体设计 |
简 介 | 抗体的抗原结合位点在它的两个可变结构域VH和VL所形成的交界处,因此VH-VL结构域的取向共同决定着抗体的特异性︻和亲和力。维持VH-VL结构域的取向在抗体工程的过程中是非常重要的,是保留原∑始抗体特性的重要因素,在抗体同源建模过程中, VH-VL预测的正确与否也极大关系着建模的准确性。本文中,作者提出了一种快速的基于序列的预测VH-VL取向的方法。 |
案例名称 | 基于系统数据驱动的分析方法识别抗癌药物化学物质的结构特点 |
参考文献 | Proteins: Structure, Function and Bioinformatics DOI10.1002/prot.24756 IF:2.921 |
软 件 | Pipeline Pilot |
研究方向 | 生物信息学 |
简 介 | 分析药物结构与生物学反应的关系是理解脱靶效应和药物副作用的关键,并可以为药物治疗方案的调整提供理论依据。在本文中,通过对多个肿瘤细胞系(CMap数据库)进行分析,作者们提出一种全ㄨ面分析药物化学结构如何影响全基因组基因表达的新方法。 |