正相键合相色谱多用于分离各类极性化合物如炸药、染料、氨基酸、甾体激素、药物和多巴胺等。反相键合相色谱系统操作简单，重复性和稳定性表现良好，已成为一种采用液相色谱仪的分析方法。极性与非极性;水溶性与油溶性;非离子性与离子性;小分子与大分子;具有差别分子量或官能团差别的同系物均可采用反相液相色谱技术分离。
在生物工程和生命科学研究中，经常涉及到对多肽、核苷、氨基酸、核酸、核苷酸、蛋白质及核碱等生物分子的分析分离，反相键合相色谱法正是此类样品的主要分析方法。人工合成药物的纯化及其成分的定量定性测定，中药中有效成分的制备、分离及其纯度测定，临床医药研ㄨ究中人体体液和血液中药物的浓度、药物代谢物的分析测定，新型高效药物对映体含量的测定等都可以采用液相色谱仪分析。反相键合相色谱方法也可适用于对环境中存在的具有高沸点的有机№污染物分析。反相键合相色谱法在食物分析方面的应用主要▓包括：食品本身组成包括营养成份的分析，如脂肪酸、矿物质、香料和维生素等;人工食品添加剂卐的分析，如抗氧化剂、甜味剂、人工合成色素和防腐剂等;在食品加工储运过程中→由环境引起的污染物的分析，如病原微∑ 生物、霉菌毒素、农药残留等。
