开乳白色小花的无油樟(Amborella trichopoda),是与地球上第一批开花植物亲缘最近的灌木。现在科学家们解码了无油樟的基因组,展现了帮助开花植物出现并征服世界的遗传学改变。这一▼发生在一亿六千万年前的进化大爆炸,被达尔文称为“恼人之谜”(abominable mystery)。
无油樟只生长在New Caledonian岛上,自成一目、一科、一属,它的一切都令植物学家着迷。“从动植物演化的角度看,它就〓相当于鸭嘴兽和单孔目动物,”无油樟基因组◎计划的领导者之一,宾州大学的植物进化生物学家Claude dePamphilis说。
研究人员利用罗氏454、Illumina和Sanger BAC-end测序数据,构建了无油樟的基因组草图。日前,这一计划的成果以三篇文章的形式,发表在十二月十☉九日的Science杂志上。
鸭嘴兽基因组为人们提供了哺乳动物出现的线索。同样,无油【樟基因组也能帮助人们理解,开花植物(或〗被子植物)是怎样通过进化与裸子植物分开的。
许多被子植物都是多倍体,举例来说,马铃薯每条染色体存在两到六个拷贝。早在2011年,dePamphilis领导的研究就曾利用有限的遗传学数据预言,开花植物的祖先出现了基因组倍增,形成了多倍体◤。现在,研究人员将无油樟的基因组与其他植︻物进行比较,证实了古老的基因组倍增现象。研究显示,无油樟的基因组倍增,先于其他所有多倍体。
DePamphilis指出,开花植物▓的出现和扩展,可能就是由基因组倍增驱动的。基因组倍增为基卐因提供了额外的拷贝,赋予了更多的进◣化可能,有助于新功能的出现。
研究人员通过无油樟基因组分析指出,在被子植物与裸子植物分开时出现的一系列基因,可以解释花的起源。研究显示,在与开花ㄨ有关的基因中,有四分之一是裸子植物不具备的,另外四分之三存在于裸子植物和被子植物的共同祖先。这项研究也为开花植物的其他特征(如复杂的种子、花香等)提供了进化线索。
British Columbia大学的植物分子遗传学家Keith Adams认为,基因组倍增帮助开花植物演化 “是一个〇有趣的假说,尽管难以进行证明。”不过,植物学家可以将无油樟基因组作为参照,在其他植物(包括农作物)中鉴定和研究基因家族。
DePamphilis的研究团队还分析了无油樟的遗〖传多样性,鉴定了四个不同的群体。他指出,鉴于这种植物非常特殊,保护其现存多样性非常重要。