可通过不同的方式进行细胞形态学测量:自动、半自动或手动(交互式)
分析区域
分析样品的第一步是选择分析区域。所有的版本仅能分析整体图像,而加强版可以对任何形状的区域进行分析。在右图的示例中,创建了分析区域(绿线内部分)仅对属于特定年轮的春材导管进行分析。这些区域可以很容易地通过在图像上描画轮㊣ 廓来选定。指令可以快速、容易地创建矩形和圆形的分析区域。
内腔和外壁面积
内腔面积自动◤测量并且是真实测量面积(基于其内包含的像素数量)而并非由直径估算。内腔基于它们的面积可以※被分成细胞和导【管群,那些大于指定值的被归类到导管,小于指定值的被归类到细胞,两个族群可以分别分析(可以获得两者总体和个体的数据)。用户可以简单地通过按键和点击目标来进▓行重新分级。外壁面积通ㄨ过计算分析区域中属于外壁的像素等级面积来自动计算。
内腔和外壁面积用于被分析区域的总值(测量单位和被分卐析区域面积的百分比),内腔面积还作为基于单独分析数据中的单另细胞或导管。
内腔面积色彩功能
除去细胞和外壁面积以外,加强版还可以利用色彩功能测量整个分析区域或部分区域(每个细胞)的内腔Ψ 和外壁面积。
管胞长度和宽度
管胞长度和宽度(或径向和纵向直径)可以用不同的方式进行计算。
最大长度和宽度 | 纵向和径向→直径 |
最大长度和宽度 : 用该方法计算的管胞长度是细胞内腔边界中最远两点间的距离。它是在任意方向上测量过的最大细胞长度。宽度是在与长度垂直↑方向上的最长距离。 | 纵向和径向直径▅: 长度是直接径向测〖量,宽度是直接纵】向测量(反之亦然)。该方法提供三种变化模式(它们的区别在于位置和测量的长度)。 |
管胞长度和宽度既可以是整个测量区域内的平均值,也可以是单独细胞或导管的值。 |
上面提及的形态学测量,在整个分析区域或通过交互式测量选定的细胞,都可以自动进行计算。在自动模式,用户所要做的事情只是点击图像或指示出分析区域和被分析区域中包含的细胞。在交互式方式,用户简单地画一条穿过细胞的线来测量。后者通︽常用来分析径向细胞行列(与年轮边界位置相关的细胞排列是众所周知的)。
交互式测量模式有4种设置
在完全手动模式中,不会自动对图像进行分析。此模式被用于测量任何用手简单地在末端点击的对象。它可以用来测量细ㄨ胞长度或用来对完整的纤维长度进行阐述。平直的对象可以通过在其末端点击两次进行测¤量,弯曲的对象可以通过在其曲率的变形点上额外点击鼠标进行测量。另外的手动模式用来成对测量对象的长度和宽度(可在之后估算面积),还可以在对比度达不到自动分析要求时对细胞进行▆测量。
两种半自动测量模式可以用来测量细胞长度和它们相邻的两个壁厚(在内腔的对侧)。一种模式在迹线方向上进行,另一种模式在放射状方向上进行。
这两种半自动测量方法也可以得出放射状细胞行列的长度(介于年↓轮分界线和轮宽度之间)。
WinCELL 特点 | |
加强版:可以分析任何形状的区域。矩形和圆形区ㄨ域可以预定义,用户还可以使用套索工具创建任意无规律的形状。当创建好区域后,可以调整大小,分析结果也会相应地自动调整。 区域可以用来分析图像中分离的不同的部分(如同右侧的春材)。 | |
WinCELL使用分析区域的概念是为了屏弃不完整的细胞。接近图像边缘或在分析区域以外的细胞在进行细胞平均测量计算(面积、长度和宽度)时可以不予考虑。 颜色可以用于细胞指示其分级(被图像边缘切割、部分→或完全在分析区域内外、操作者遗弃、碎片、介于细胞或导管间的细胞类型)。 | |
在测量期间测量数据是交互式的,文本格式的文件可以被许多程序软件读取。这些文件可以很容易地被诸如 Microsoft Excel 的电子表格程序打开。用户也可以点击一个细胞来显示其形态学测量数据。细胞分布的柱状图可以在分析期间或在 XLCell 程序处理后看到,它也可以表现细胞结构参数的整体观。 | 细胞分布柱状图显示了不同面积、长度、宽度细胞的数量。对加强版为颜色功能面积。 |
图像编辑可以补偿缺陷或々差对比度(例如夏材细胞的内腔经常是暗黑的) | 图像可以用任何颜色编辑。可以容易地选择图像中表现的颜色并用它编辑。通常可以使用工具笔(用来画线)和工◥具索套(用来确定区域轮廓)进行编辑。 |
加强版:缺陷或不希望被分析的区域可以用 排除区域 或编辑图像来排除, 排除区域 可以是任何形状。 | |
WinCELL 可以分析灰度或彩色图像(我们的相机这两种图像都可以产生)。加强版在彩色图像上可以做更多的分析。 它可以显示和分析彩色图像的三中色彩通道之一,使用色彩来更好地在内腔和外壁或色彩量化区域对像素进行分类。 | |
内建校验程序并可很容易地用显微镜厂商的目标来执行,支持不同的目标模式。 | |
碎片可以自动地由尺寸过滤,或通过编辑图像手动处理ㄨ。 | |
由 WinCELL 获取的原始图像,无论是否经过分析,都可以存储成标准的 tiff 或 bmp 文件,这些文件可用于其它应用程序( MS Word, Photoshop 等)。 | |
批处理可以分析一系列图像而无须操作人员监督。这中分析方式仅能以自动模式进行(非交互式)。 | |
可以在配置文件中存储分析设置,在后续操作或重复操作中使用。 | |
用户可以选择存储的数据类型。 | |
WinCELL 也可以做为通常的面积仪使用(例如测量叶面积),更改一些默认设置后,也可以作为其它物体的形态学分析设备来使用。 | |
当购买 WinDENDRO 系统时, WinCELL 标准版软件是免费附赠的。 | |
WinCELL 会规律升级。 |