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QSAR with CoMFA用于建立反映分子结构与性质（包括生物学活性）关系的统计和图形模型。用于化合物的◆结构修饰及改造。用户可以利用这些模型快速而且精确地预测新 化合物的类似性质,指导化合物的结构修饰和改造。比较分子场分析(CoMFA)是Tripos的专利软件模块，已经被数以百计的QSAR研究选择应用。在 QSAR with CoMFA模块内用户先将分子结构及相关的活性交付分子表单组织管理，然后计算分子描述符，可以计算的描述符有许多种，包括EVA和CoMSIA场，接着 QSAR with CoMFA使用多种成熟的数据统计分析工具揭示构效关系。一些重要的分子描述变量如EVA和CoMFA场可以单独或与其它变量组合使用。所有的模型都通过 QSAR with CoMFA的交叉验证，最终的结果可以在SYBYL/Base内以清楚且易于解释的图形模式输出。CoMFA结果的可视化增加了构效关系研究者与合成化学 家交流的直观性和可信度，而且，专业化的图形工具能最大程度地帮助使用者针对特定的问题去模建、解释和理解三维定量构效关系。
