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TPSA
分子极性表面积（PSA）是一个描述与分子被 动传输通过膜相关的概念，它可以预测人体肠吸收、Caco-2单层渗透性和血-脑屏障渗透。为了简化极性表面的计算，Ertl等提出了拓扑极性表面积 （TPSA）的概念（J Med Chem. 2000 Oct 5, 43(20)：3714-7）。它的基本假设是分子中每种相同原子或基团类型对极性表面积的贡献都是︼相似的，整个分子的TPSA就是所有原子或基团贡献的 加和。TPSA的基本思想和脂水分配系数以及水溶性计算中的加和法基本相似。
原理:
TPSA是基于规则的专家系统，计算的参数是基 于已有极性片段数据库的。这些片段的贡献是通过对来自于世界药品库34810个药物单个构象3D PAS的最小二乘法╱拟合来确定的。 实际上TPSA提供的结果和经典的3D PSA的结果是一致∞的，而计算的速度较经典的快2到3个数量级。
应用方案:
在合成化合物之前，可以高通量预测TPSA值；
预测脑血分配系数，例如采用Kelder方程：lgBB=1.33-0.032PSA；Clark方程：lgBB=0.55-0.016PSA ;
预测肠通透性，例如：对Stenberg等』人发表的14个化合物，PSAd＜60Å2时，分子能够被完全吸收；PSAd＞140Å2时，分子的通透性很差；PSAd在60~140Å2之间时，分子的通透性随极性表面积的增加而逐渐减小。
