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MolegroVitualDocker是跨平台(Linux,WindowsandMac)的预测蛋白质跟化学小分子结合的软件,软件提供在Docking过程中所需的所有功能,从分子结构的preparation到bindingsite的预测以及最后的小分子的结合及构造(conformation)。软件本身有最新的演算法,可以提供高准确性的docking结果,以及简单好用的视窗界面操作。
MolegroVirtualDocker能提供高品质的对接,这种对接的基础是与实用性和产出性高见长的用户界面相结合的新型优化技术。
事实证明,MolegroVirtualDocker(MVD)的对接精度高于其它先进的对接产品MVD:87%,Glide:82%,Surflex:75%,FlexX:58%).
MolegroVirtualDocker的优势:
对接精度高:对接引擎已被证明可以高精度地识别结合模式。MolegroVirtualDocker的结合模式识别正确度要高于其它的对接程序.
易于操作的用户界面:内置的向导使用户能够轻松地安装和运行对接程序。高级的可视化和分析工具可以帮助用户研究配体-受体的相互作用和优化对接方案。
跨平台协同工作:软件支持Linux,Windows和Mac操作平台,许可平台间协同工作。
MolegroVirtualDocker的特点:
可以方便的进行分子输入和准备。
对接向导可以控制对接的过程。
分析—造型管理器可以让你浏览由对接引擎返回的造型。
序列》和结构可视化—序列浏览器可以让您快速的识别和挑选蛋白质的残余。
约束力—各种制约因素让改变能源景观变为可能,也可以强制或者阻止某些事件的相互影响。
分析器—MVD的数据分析器可以创建回归模型、提取物统计数据并实现数据可视化。
侧链的灵活性——在MVD中,侧链的灵活性是通过软化对接中的潜力实现的。
内置的编辑器可以扩展和定制宏观系统。
生物分子发生器(Biomoleculegenerator)的PDB文件包含了分子对称转变的信息。
高级文本标记法可以标记各种分子性质。
可以通过在线帮助和自动校验进行更新。
MVD可以使用自身或者是外部的脚本语言(包括Pythonwrapper)。
外观修饰器可以手动的更改外观。