亚硫酸氢盐的完全转化和DNA回收,用于甲基化分析
完整的EpiTect离心和真空过※程只需6小时,包括从DNA到待分析的亚硫酸氢盐转化后的高纯DNA。EpiTect 96 Bisulfite操作时间少于7小时。传〓统的亚硫酸氢盐转化过程需要18个小时,且需要大量的操作。EpiTect Bisulfite Kit为成功进行亚硫酸氢盐转化和DNA回收提供所需的全部试剂。
EpiTect流程 | 传统流程 | |
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反应构建 | 10分钟;预制溶液 | 40分钟;需反应构建 |
亚硫酸氢盐转化 | 5小时 | 16小时 |
纯化 | 30–45分钟; EpiTect离心柱或孔板 | 120分钟;纯化、脱璜、沉淀和洗涤 |
每个EpiTect Bisulfite Kit可以相同的效率转化低至1 ng到2 μg DNA。全新的实验步骤和优化的缓冲液可回收得到高产量的转化DNA。当通过real-time PCR扩增经转化的※DNA时,低CT值的实验结果显示了高←效的胞嘧啶转化。对转化的DNA的分析显示,EpiTect Bisulfite Kit可转化超过99%的非甲基化的胞嘧啶。高转化率确保了高重复性和可靠的下游●分析结果。
从珍稀样本和少量样本(如:福尔马林固定、FFPE石蜡包埋或显微切割组织)中确定甲基化模□式,由于DNA的量很少,实验尤其困难。但是这些〒样本类型是成功鉴定有价值的疾病,预测生物标记物的专门研究对象。 EpiTect Bisulfite Kit 为这些类型的样本提供优化的操作流程,从而解决了难题。该试剂盒含有实验所需的全部缓冲液和试剂,只需少量的手动操作。
对于从FFPE样本、细胞、血液及组织中直接进行亚硫酸氢盐转化而无需预先分离DNA,我们推荐使用EpiTect Plus FFPE Bisulfite Kit和EpiTect Plus LyseAll Bisulfite Kit。
DNA保护缓冲液采用独特的配方,防止DNA过度降解(在高温、低pH值条件下使用亚硫酸氢盐处理DNA时经常出现严重◥的DNA降解),并实现有效的DNA变性,从而产生完全转化为胞嘧啶时所需的单链DNA。防止DNA降解的发生可以保证后∴续大PCR片段的扩增和分析。DNA保护缓冲液含有PH指示¤剂染料,从而可保证用于胞↘嘧啶转化的正确的pH条件。有效的完整DNA回收可保证转化后的DNA至少保存12个月而不影响DNA的质量。
EpiTect Bisulfite操作流程基卐于QIAGEN简单直接的结√合、洗涤和洗脱体系,仅需几个简Ψ 单的步骤。DNA经过热变性和亚硫酸氢盐转化后,被上样到EpiTect离心柱或96孔板上,使用优化的缓冲液和标准化的离心步骤或真空装置,洗去所有的亚硫酸氢钠并洗脱DNA。洗脱的DNA可用▃于各种下游应用,如:甲基特异▓性PCR、real-time PCR分析、亚硫酸氢盐转化后测序(bisulfite sequencing)、结合亚硫酸氢盐的限制性内切酶法分析(COBRA)和焦磷▼酸测序(Pyrosequencing)。
表观遗传学信息对于生物医学研究(尤其是肿瘤学)、干细胞研究以及『发育生物学等领域都非常重要。但是分析DNA甲基化的变化目前仍具有挑战性,因为缺乏标准化的方法可从有限的样本中得到可重现性的数据。QIAGEN推出新←的表观遗传学解决方案,使样本分析前处理到分析ζ 整个过程实█现标准化,即从DNA样本收集、稳定和纯化,到亚硫酸氢盐转化和real-time或终点式PCR甲基化分析或测序。
经EpiTect Bisulfite Kit转化和纯化的DNA适用于多种下游应用,如: