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                超高通量基因组测▃序系统Genome Sequencer FLX System

                超高通量基█因组测序系统Genome Sequencer FLX System
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                详细说明

                超高通量Ψ 基因组测序系统Genome Sequencer FLX System

                 

                GS FLX系统具备专业的分析工具,涵盖用于图谱绘制、序列拼接和扩增子变异检测等各类简单、易操作的图形用户界面(GUI)。测序』读长更长,
                ■ 平均可达400-500bp(图1);
                ■ 通量更高,每单次运行可获一百万条高质量数据;
                ■ 速度更快,完成一次测序仅需10小时;
                ■ 准确率更高,单条读长超过400bp时,测序准确率仍高于99.6% ;
                ■ 多倍覆盖〓下,准确率高于99.99%。

                灵活的GS FLX系统, 突破更多的应用领域
                ■ 全新基因组测序和序列拼接
                ■ 重测序和图〓谱绘制
                ■ 转录组分析
                ■ 表观遗传学变异检测
                ■ 宏基因▲组学和微生物多样性
                ■ 古生物DNA
                ■ 病毒基因组测》序
                ■ HIV 测序
                ■ 扩增子重测序

                上样及样品DNA片断化
                GS FLX系统支↑持各种不同来源的样品序列测定:包括基因组DNA、PCR产物、BACs和cDNA等等。基因组DNA和BACs等样品需被打断至600-900bp的小片断。对于像非编码RNA或PCR扩增子等小分子样品,则不需要这一步。而通过GS融合引物扩增得到的短片段PCR产物可以直接将其固定于DNA捕★获磁珠上,如下文“一个片段=一颗磁珠”中所示。
                文库的◆制备
                利用分子生物学技术,将3和5端的特※异性接头(A和B)连接至每一条DNA片断两端。这些接头将被⌒用于之后的纯化、扩增及测序步骤。含有接头A、B的单链DNA片
                断即构成了工作流程中的DNA文库。(其中GS FLX Titanium 系√列试剂盒提供的接头A和B片段不同于GS FLX 标准系列试剂盒提供的)。
                一个片段 = 一颗磁珠
                单链DNA文库被固定于特殊设计的DNA捕获磁珠上。特异接头使◤各条DNA 片段分别结合于各自唯∞一的磁珠之上。结合有不同DNA的磁珠文库经ω油水混合的扩增试剂
                乳化分散后,形成成百☉上千颗微乳滴, 每一微乳滴内仅含有一颗磁珠和一条特异的样品DNA片段。
                emPCR 扩增(乳滴PCR)
                每一DNA片段在其各自的微乳滴中进行独立扩增,排除了其它竞争性或污染性序列对PCR反应的影响。所有DNA片段平行扩增↘,各个磁珠上的不同DNA片段均获↑得数
                百万个扩增拷贝。随后,打破微乳滴∩,得到结合于各磁珠的特异扩增片断。
                一颗磁珠 = 一条读长
                将所有结◣合有DNA片段的磁珠置于PicoTiterPlate(PTP板)中进∑ 行测序。PTP板的孔径恰好仅能容纳一颗磁珠。将PTP板置于GS FLX测序仪中,单个核ζ苷酸依次流经孔洞
                和DNA捕获⊙磁珠间。当所加入□的一种或多种核苷酸与模板互补时,便产∞生化学发光信号,进而被 GS FLX系统的CCD相机记录。
                数据分析
                通过ω 信号强度和PTP板上的位置信息,内置软件能够在10小时测序运行的同时』对1,000,000条数据进行分析。对于测序数据的分析,三种不同的生物信息学分析工具分
                别支持以下应用:(1)对高达400Mb大小的全新基因组拼接;(2)对高达3Gb大小的基因」组图谱分析;(3)专用于〗扩增子重测序的图形用户界面。


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