NeoSuite CADD是北京创腾科技有限公司基于Pipeline Pilot信息整合平台和Discovery Studio中的最新模拟方法,并结合国内多个知名药物研发课题组自主开发的模拟工具和数据库,搭建了一个全中△文的基于网页的药物分子设计平台。与其它常见的计算机辅助药物设计(CADD)和专业级别的分子模拟软件相比,NeoSuite CADD是专门针对药化实验人员开发,包含丰富实用的CADD工具,并以最简易便捷的方式提供人们使用和操作,满足科研人员特别是药化实验人员日常计算和研究的需〗要。
功能和特点:
NeoSuite CADD v2.0包含药化实验人员常用药物设计流程和工具,方便的文件输入△输出功能,支持常用化学文件格式,支持网页三维结构的显示和操作。当前版本包含的主◎要功能特点如下:
• 简单的安装操作:NeoSuite CADD v2.0在使用时直接使用浏览器来登录使用,用户无¤需安装客户端软件,通过鼠标的点击和参数的设置,就能完成@常用的药物设计计算工作。
• 安全的用户认证:NeoSuite CADD v2.0允许添加/管理◥该系统的用户帐号。使用时,用户可以使用自己的帐号进行登录,使用完需要注销登录。
• 方便的化合物管理:NeoSuite CADD v2.0可以让每个使用人员拥有自己◣的化合物库列表。用户可新建≡化合物库、删除化合物库和预览化合物库,并对化合物库进行计算操作。
• 计算任务的选择和使用:NeoSuite CADD v2.0提供超过30个常见的药物〇设计计算工具,并按照功能分成三类,包括化学〗信息学工具、药物设∮计工具和生物大分子╱工具,用户可以方便点击选择任务和设置参数,并显示全中文的在线帮助信息。
• 化ξ学信息学工具:提供了常见的化合物结构处理工具和化学库的构建、分析、查询、报告工具。例如结构二维与三♀维转化、类药性五规则筛选、基于反应的虚拟化合物枚举、基于R基团的虚拟化合物枚举、生物等★电体枚举、聚类分析、SDF文件内容查看和『报告、结构相似性检索、结构标准化等。
• 药↓物设计工具:提供了在药物设计领域的通用工具和一些特别设计的流程,可以满足实验人员对于药物设计的㊣常见需求。例如ADME毒性和代谢产物预测、LogP等物化〓性质计算、SAR分析报告、QSAR模型构建和预测、药效团数据库PCDB查询和导出*、药效团筛选(包括多药效团反向找靶)、快速分子对接等。
• 生物大分子工具:提供在药物设计领域通常涉及到的一些生物大分子处理工具,包括序〒列的BLAST查询和比对、蛋白的结构优化和叠合、全自动@ 化蛋白同源模建等。
该计算任务可能需要购买第三方软件
自定义类药性五规则筛选 基于R基团的虚拟化合物库枚举
活性化合物库的SAR分析报告 基于药效团的反向找靶功能
快速分子对接功∏能(在线显示三维结构) QSAR模型的建立
基于ClustalW算法的蛋白多序列比对 蛋白三维结构叠合
关于NeoSuite:
NeoSuite是北京创腾科技№有限公司自主开发,用于药物企业和研发机构的药物分子信息管理和智能↓分析系列产品工具包,包括NeoSuite CMS——化合物样品管理系统,NeoSuite CIMS——化学试剂库存管理系统,NeoSuite CADD——基于Web的药∞物设计平台。