利用Map viewer 查找基因序列、mRNA 序列、启动子(Promoter)

　　NCBI (National Center for Biotechnology Information)是指美国国立生物技术信息中心。理解自然无声但精妙的关于生命细胞的语言是现代分子生物学的要求。

　　发现新的手段去处理这些数据的容量和复杂性，并且为研究人员提供更好的便利来获得分析和计算的工具，以便推动对我们遗传之物和其在健康和疾病中角色的︼理解。

　　NCBI首先创建GenBank数据库，在重点开发GenBank的同时，又于1991年开发了Entrez 数据库检索系统。该系统整合了GenBank、EMBL、PIR和SWISS-PROT等数据库的序列信息以及MEDLINE有关序列的文献信息，并通过〓相关链接，将他们有机地结合在一起。NCBI还提供了其它数据库，包◣括在线人类孟德尔遗传(OMIM)、三维蛋白结构的分子模型数据库(MMDB)、人类基因序列集成(UniGene)、人类基因组基因图谱(GMHG)、生物门类(Taxonomy) 等数据库。上海创赛科技提供猪白细◣胞介素6Elisa试剂盒，Porcine Interleukin-6,IL-6 ELISA Kit ,商品编号：LH-E10103PO-96T，价格1530元。

　　下面以人的IL6(白细胞介素6)为例讲述一下具体的操作步骤

　　1.打开Map viewer 页面，网址为：http://www.ncbi.nlm.nih.gov/mapview/index.html在search 的下拉菜单里选择物种，for 后面填写你的目的基因。操作完毕如图所示：

　　2.点击“GO”出现如下页面：

　　3.在步骤二图示的右下角有一个Quick Filter,下面是让你选择的几个复选框，在Gene前面的小方框里打勾，然后点击Filter. 出现下图：

　　4.点击上述三条序列第一条序列(即reference)对应的"Genes seq"，出现新的页面，页面下方为：

　　5.点击上图出现的“Download/View Sequence/Evidence ”，即下载查看序列等功能，结果如图所示：

　　先对上面这张图做点简要的说明，在Sequence Format(序列输出格式)后面是一个下拉式↙选择菜单，默认的为FASTA 格式，还有一个是GenBank 格式。我推荐大家选择GenBnak格式，因为这个格式提供了很多该基因的信息，而FASTA 格式只有基因序列。

　　6.在Sequence Format 后选择GenBank，然后点击下面的Display，目的基因⌒的相关信息和序列就出现在眼前了。在上述打开的】网页中，你可以看到基因长度，基因序列，以及这个基因是如何被报道出来的等各种信息。

　　图中: mRNA join(3598..3678,3841..4031,5090..5203,5911..6057, 7803..8394)这代表了从◎基因的3598 位开始㊣　就是转录区了，即我们常说的mRNA 片断，由于内含子的存在，所以mRNA 在DNA 序列上分成了几段。

　　CDS join(3660..3678,3841..4031,5090..5203,5911..6057, 7803..7970)

　　CDS 代表编码序列，即蛋白编码区是↓从3660 开始的(ATG)，由于剪接作用所以CDS 区也＠是不连续的。

　　说到这里，可能很多朋友都已经明白了promoter 即启动子区域在哪里了：转录起始位点前面是基因的调控区，启动子区没有明显的位置定义，大家也◤只是猜测它的大体位置，如果要①研究promoter 区的话，建议选择转录起始位点前的2000个碱基进行研究，一般默认的是这样。当然如果觉得长度太长不好研究的话，也可以只研究-1000 到0 这一千个碱基，因为一般情况◣下，启动子区的变异都在这个区域内。

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