近日,国际科学界宣布“DNA元素百科全书”(简称ENCODE)计划获得了迄今最详细的╲人类基因组〗分析数据,并以30余篇论文的形式同时发表在Nature、Science、Genome Research、Genome Biology等一系列高水平的SCI学术期刊上。ENCODE被认为是继“人类基因组计划”之后国际科学「界在生命科学研究领域取得的又一重大进展。以往研究者常关注与编码蛋白质相关的基因,但它们只占整个基因组的约2%。ENCODE研究团队完成了解析基因组非编码区域的工作,人类基因组中约80%的区域都被确定拥有某◣种确定的功能。ENCODE项目从近期看有利于测序产业,基√因组会成为更热的研究方向,而从长〇远来看,其影响深远,对疾病诊断、药物研发等都将具有积极的推动作用,新增市场价值当以万亿美元计算。
中科院北京↘基因组研究所“百人计划”方向东研究员项目组利用与美国华盛顿大学基因组学系建↘立多年的合作关系,选派该组青年科技骨干渠鸿竹博士,通过多次访问交流和客座研究等形式,与ENCODE计划负责人∏之一、美国国立卫〇生研究院西北注释表观基因组绘图中(Northwest Reference Epigenome Mapping Center,NIH)主任John A. Stamatoyannopoulis博士所领导实▲验室研究人员一起工作,迄今为止已经共同发表了三篇标志性的ENCODE文章。
在渠鸿竹博士作为共㊣ 同第一作者、基因组所第二作者单位的Genome Research发表文章中,渠鸿竹博士主要负责生物信息学分析工作,将重要转录因子与染色质DNA之间的相互作用和DNA甲基化这两个不同层次的表观基因组学数据进行统合研究,对于CTCF在染色质DNA的结合效率和DNA甲基化之间的相互关系进行研@究并取得了创新进展。在基因组所作为第二作者单位的Science所发表文章中,渠鸿竹博士作为生物信息学团队〓的主要成员,主要负责将全基因组DNase I图谱等表观基因组数据与已有的GWAS SNPs数据结合,首次在表观基因组水平上开展GWAS研究工作,为研究复杂性疾病的ξ 遗传机制提供了全新的研究策略。
在9月5日Nature在线发表的文章中,渠鸿竹博士与Stamatoyannopoulis博士实验室研究人〓员利用新一代高通量测序平台完成了125种人类细胞和组织的DNase I 高敏感∩微点(DHSs)的全基因组图谱,首次展示了至今为止最为详尽的人类基因组调控DNA图谱,揭示了染色质可及性、转录、DNA甲基化、序列特异◣性转录因子结合谱式等不同层次的︼表观遗传调控因素之间复杂的相互关系。本项研究对▓于彻底读懂、读通人类基因组这本“天书”具有重要的意义。
基因组所√通过“引进来、走出去”等灵活多样的合作培养〓机制,与美国芝加哥大学、美国华盛顿大学、美国西南医学中心大学、等国际※顶尖研究机构保持了密切的交流与合作关系,积极参与重大科学研究∞计划,及时把握世界前沿科学的发展▅脉络,有效提升研究所的学术地位和国际声誉,努力培养青年科技骨干人才快速成才。过去几年的成功经验▅证明,基因组所在人才队伍建设方面已经进行■了有益的探索,并且获得了令╱人瞩目的成果,为今后的科技创新争优工作的可持续发展奠定了坚实的基础。