1、生物显微镜用的是透射照明，一般用来观察透时和半透明的样本，不能用来观察不透明物体，而金▽相显微镜主要是落射照明方式，光源从物镜射出，主要用于观察不透明样本的表面，当然』也有附带透射照明装置的较高级金相显微镜，可同时用于观察透明样本。
2、从物镜来看，生物显微镜的高倍物镜都有考虑盖玻片厚度(0.17)和载玻片、培养器皿厚度(1.2)，所以其物镜是通常标有/0.17(正置显微镜)、/1.2(倒置∩显微镜)，正置生物显微镜10倍以下物镜则是/-，也就是可♂以不考虑，这是为了校正玻璃对于光折射的影响，而金相显微镜的物镜通常标有/0。
生物显微镜与体视显微镜及金相显微镜的区别体视显微镜也叫做立☆体显微镜，与生物显微镜主要区别如下：
一、体视显微镜的工作距离较大，通常可以达到50mm甚至150mm;而生物显微镜的检测物体的工作距离范围很少超过20mm。
二、体视显微▲镜可以放置较高，较厚的物体◣，如集成电路块，较大的工件，螺丝，较〓厚的物体等等，而生物显微镜只能放置薄片，载玻片等等。
三、体视显微镜景深范围较大，可达达到10mm的景深范围，调节↓聚焦环，相当大的范围可以看见↘清晰的图像;而生物显微镜可能稍微转动调焦环，就看不清楚了。
四、体视显微镜可以看见立体的图像，因为景深范围较宽的缘故。但是放大倍数较小〓，一般立体显微∏镜最大√倍数最大做到200倍左右;而生物显微镜的最大放大倍数一般做到2000倍左右，生物显微镜的特性参数正好与体视显微镜相㊣ 反。所以说，体视显微镜和生物显微镜的适应范围是不相同的，镜头的结构也有所区别。
